Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  272  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89200078--89200253
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1.77
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159
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5.2
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10
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2.0
26
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1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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98
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0
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2.2
19
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0
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1.9
161
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1.9
63
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30
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3
20.7
3
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63
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3
61
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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10
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26
22
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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2.5
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24
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16
14
1.88
89374162--89374270
52
2.1
52
88
3
159
30
17
17
34
1.93
89376443--89376551
56
1.9
56
92
0
182
40
11
13
33
1.82
89378819--89378871
20
2.7
20
90
0
79
52
5
20
20
1.66
89382080--89382208
42
3.0
41
74
6
123
33
23
14
28
1.94
89384948--89385004
18
3.2
18
94
0
96
36
14
19
29
1.91
89385590--89385763
43
4.0
43
77
12
155
30
25
19
24
1.98
89385600--89385761
86
1.9
85
83
8
213
30
24
19
25
1.98
89388191--89388222
6
5.3
6
96
0
55
43
15
21
18
1.87
89389200--89389237
4
9.2
4
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5
58
0
21
2
76
0.91
89389199--89389235
13
3.0
12
92
4
56
0
18
2
78
0.87
89389357--89389395
19
2.1
19
85
9
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33
5
7
53
1.51
89395036--89395140
39
2.7
39
93
0
174
32
21
22
22
1.98
89399352--89399376
4
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4
100
0
50
0
24
0
76
0.80
89399497--89399535
19
2.1
19
85
9
53
33
5
7
53
1.51
89399580--89399655
20
4.4
17
73
18
61
50
3
1
44
1.29
89402102--89402599
84
5.9
84
80
6
359
42
11
12
34
1.77
89402102--89402612
168
3.0
171
77
8
468
42
11
11
34
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89402212--89402909
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8.4
85
75
12
402
42
10
12
34
1.77
89402185--89402990
84
9.6
85
74
13
423
42
10
12
34
1.78
89402444--89402776
165
2.0
163
83
4
409
41
11
13
33
1.80
89403135--89403173
16
2.4
16
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0
51
56
0
5
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1.22
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2.2
22
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0
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25
8
27
1.84
89410400--89410430
14
2.2
14
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0
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35
0
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19
2.0
19
100
0
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10
10
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89421398--89421438
16
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17
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17
1.44
89425655--89425702
26
1.9
24
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31
0
4
64
1.12
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16
2.1
16
88
5
50
70
8
0
20
1.13
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14
2.3
15
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5
52
29
5
0
64
1.17
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3
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3
100
0
70
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0
0
68
0.90
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18
3.6
17
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51
25
9
1
63
1.33
89438730--89438791
23
2.8
22
76
9
63
22
8
0
69
1.14
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2.1
38
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24
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1
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1.29
89439698--89439726
14
2.1
14
100
0
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0
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100
0
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0
0
50
1.00
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163
2.0
163
100
0
656
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17
28
1.95
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10
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33
2
0
63
1.08
89445276--89445316
17
2.3
18
80
16
50
39
0
0
60
0.96
89445267--89445342
27
2.9
25
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12
82
34
2
0
63
1.09
89445288--89445355
36
1.9
35
88
8
102
32
2
0
64
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89445862--89445930
29
2.5
28
84
11
88
62
14
1
21
1.40
89446604--89446646
22
2.0
22
90
0
68
34
2
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46
1.60
89451877--89451916
17
2.4
16
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17
5
0
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25
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1.42
89453031--89453104
27
2.8
29
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33
8
0
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100
0
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171
33
19
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34
1.90
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29
3.4
29
97
0
178
25
29
10
34
1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356