Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   

This is table  217  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70959685--70959722
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3.8
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70964014--70964152
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244
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31
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24
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0
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20
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11
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0
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25
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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1.80
71006699--71006918
83
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207
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402
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2.4
18
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27
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61
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2.0
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0
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1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
2.00
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22
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2.00
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38
100
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2.4
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1.97
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1.8
135
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312
27
23
17
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71159995--71160073
27
2.9
28
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9.0
27
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27
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27
22
25
2.00
71174271--71174425
79
2.0
79
82
7
190
26
27
20
25
1.99
71174308--71174436
40
3.3
40
84
4
174
27
27
20
24
1.99
71198776--71198993
79
2.7
80
81
7
248
26
27
21
25
1.99
71198790--71198993
40
5.1
40
82
7
245
26
27
21
24
1.99
71206795--71206997
40
5.1
40
79
9
209
25
28
22
24
1.99
71206781--71206996
79
2.7
79
80
8
224
25
27
21
25
1.99
71212923--71213045
44
2.8
44
76
10
137
25
17
27
30
1.97
71214272--71214420
42
3.5
43
75
10
128
30
21
22
26
1.99
71215211--71215334
64
1.9
65
80
8
146
28
20
28
22
1.99
71224018--71224057
15
2.7
15
88
0
53
20
15
10
55
1.68
71224644--71224688
21
2.1
21
100
0
90
28
8
13
48
1.72
71231065--71231118
25
2.2
25
96
0
99
37
14
25
22
1.93
71231516--71231540
13
1.9
13
100
0
50
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4
24
40
1.73
71232650--71232776
44
3.0
43
76
14
145
25
17
27
29
1.97
71240185--71240283
52
1.9
51
83
6
128
57
2
5
35
1.32
71240831--71240869
20
2.0
19
85
5
51
38
10
7
43
1.67
71241128--71241156
10
2.9
10
100
0
58
41
0
6
51
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71249833--71249857
13
1.9
13
100
0
50
40
8
4
48
1.51
71250050--71250163
42
2.7
42
80
0
120
42
17
23
16
1.89
71251542--71251664
61
2.0
61
98
0
237
28
17
18
35
1.93
71254637--71254711
27
2.8
27
83
0
87
21
16
21
41
1.90
71256889--71257208
46
6.7
47
73
14
178
25
30
17
26
1.98
71258047--71258352
27
11.6
27
87
4
394
20
13
22
43
1.86
71258230--71258301
22
3.0
22
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10
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15
16
22
45
1.84
71263763--71263858
31
3.0
31
83
8
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40
10
19
29
1.85
71263763--71263848
34
2.7
32
89
7
129
40
11
18
29
1.86
71264639--71264732
46
2.0
46
91
0
152
32
7
26
32
1.84
71274947--71275016
35
2.0
35
91
5
115
32
5
22
38
1.78
71276938--71277027
44
2.0
44
89
8
139
26
15
33
24
1.95
71276982--71277163
49
3.7
50
74
8
160
25
19
29
25
1.98
71278005--71278111
34
3.1
34
93
0
178
34
28
14
21
1.93
71279281--71279564
40
7.1
37
85
7
237
26
21
27
25
1.99
71279281--71279545
80
3.3
80
88
4
376
25
21
27
25
1.99
71279282--71279578
80
3.7
78
85
6
332
26
21
26
25
1.99
71279334--71279578
120
2.1
118
85
6
325
26
20
26
25
1.99
71286612--71286797
40
4.7
40
88
5
252
24
21
27
26
1.99
71286665--71286830
80
2.1
79
86
5
228
25
20
27
26
1.99
71291129--71291203
33
2.3
32
95
2
132
36
14
22
26
1.93
71299222--71299392
93
1.8
93
91
2
281
28
29
20
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71299214--71299387
46
3.8
44
75
11
179
29
29
19
21
1.98
71299219--71299408
46
4.1
46
68
20
119
28
28
20
22
1.98
71305484--71305614
38
3.2
38
72
17
118
30
22
17
29
1.97
71305529--71305651
48
2.6
47
85
3
167
30
21
17
30
1.96
71306405--71306569
84
2.0
84
100
0
330
40
18
18
22
1.92
71311312--71311439
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2.7
48
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1
150
32
25
13
28
1.93
71315834--71315870
19
1.9
19
94
0
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32
21
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1.98
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1.95
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29
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29
84
1
127
27
16
28
28
1.97
71331401--71331426
7
3.7
7
100
0
52
0
11
46
42
1.40

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356