Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          353   354   355   356   

This is table  313  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101522798--101522841
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2.1
21
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2
0
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0
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0
0
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0
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1
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1.13
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133
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18
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2.0
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0
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2.0
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24
2.00
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1.99
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0
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5
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2.0
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2.1
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2.2
13
100
0
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7
50
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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0
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0
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0
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0
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0
35
0
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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23
0
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101660216--101660282
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3.0
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16
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25
0
8
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1.21
101663238--101663360
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2.0
63
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0
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17
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28
3.2
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24
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16
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0
86
34
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0
28
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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0
44
16
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101730864--101730934
24
3.0
23
77
6
70
76
4
9
9
1.15
101740575--101740628
20
2.7
20
91
0
90
9
29
38
22
1.85
101741422--101741575
52
2.9
52
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177
29
27
16
25
1.97
101748779--101748930
52
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8
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26
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101749062--101749103
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14
100
0
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7
0
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24
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184
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0
1054
35
19
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2.0
30
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0
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2.0
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3
12
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1.58
101776446--101776552
9
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9
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0
2
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1.11
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0
1
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2.0
17
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0
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5
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101776724--101776828
28
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2
1
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1.21
101776724--101776828
56
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2
1
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1.21
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4.8
19
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20
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3
2
61
1.24
101776795--101776909
27
4.2
26
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12
79
34
0
3
60
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
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5
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34
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12
2.2
12
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0
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23
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2.3
18
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13
0
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23
2.0
22
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0
0
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104
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0
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0
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43
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0
0
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0
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0
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1
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2.0
60
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0
193
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0
10
52
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101839871--101840045
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2.2
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220
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1
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1
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1.50
101839898--101840066
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2.3
72
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293
29
1
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0
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0
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0
0
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0.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356