Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  299  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97513915--97514227
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163
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21
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
A
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327
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28
21
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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1.02
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69
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5
161
52
6
2
38
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97704932--97705152
66
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65
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9
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26
26
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1.71
97705093--97705185
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2.1
44
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0
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21
27
4
46
1.70
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1.29
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13
57
58
0
8
33
1.28
97708797--97708865
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29
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1
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1.36
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23
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23
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42
14
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13
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0
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173
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1.84
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97733683--97733751
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39
34
0
26
1.57
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2.3
53
77
0
131
18
17
23
40
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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93
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22
19
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1.98
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2.7
26
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0
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16
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3.4
120
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0
0
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2.0
156
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30
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2.2
30
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5
78
47
4
3
44
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97794507--97794633
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2.9
44
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10
109
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5
0
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0
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0
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2.0
46
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0
162
31
2
24
42
1.67

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356