Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   

This is table  21  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7155362--7155425
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29
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1.9
126
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1
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16
22
17
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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20
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7263675--7263726
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2.0
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132
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20
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2.5
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0
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2.0
21
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34
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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0
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220
45
3
5
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144
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0
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3.4
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11
55
2
16
2
79
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7442630--7442688
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2.0
30
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0
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35
0
8
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1.30
7442652--7442720
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20
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15
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1
7
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1.38
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0
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0
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4
0
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16
0
30
1.49
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111
4.3
112
88
8
616
52
15
0
31
1.49
7449260--7449514
131
2.0
129
86
1
357
29
18
16
35
1.93
7453221--7453270
25
2.0
25
96
0
91
34
14
16
36
1.88
7456512--7456579
3
22.7
3
100
0
136
33
0
32
33
1.58
7460126--7460181
26
2.2
26
83
3
69
30
14
19
35
1.91
7461651--7461706
26
2.2
26
96
0
103
37
26
5
30
1.79
7466694--7466952
131
2.0
129
92
1
428
35
19
19
26
1.95
7467443--7467488
14
3.1
15
78
12
51
54
4
2
39
1.32
7472543--7472676
22
5.7
23
73
18
116
37
17
24
20
1.94
7472543--7472667
47
2.7
46
90
6
191
38
17
24
20
1.93
7475078--7477651
922
2.9
895
97
2
4761
29
22
8
39
1.84
7475966--7477651
461
3.7
461
99
0
3309
29
22
8
39
1.84
7479342--7479379
18
2.1
18
90
9
60
60
0
5
34
1.19
7492899--7492945
16
2.9
16
81
6
51
65
0
0
34
0.93
7521057--7521329
151
1.8
151
91
1
449
22
28
26
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7524468--7524506
20
2.0
20
89
0
60
51
0
5
43
1.24
7525126--7525169
23
1.9
23
86
9
63
40
6
0
52
1.28
7532379--7532412
16
2.1
17
88
5
52
79
8
2
8
1.03
7537202--7537244
12
3.6
11
84
12
50
34
0
6
58
1.25
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3
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3
100
0
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0
0
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6
4.5
6
100
0
54
18
18
14
48
1.82
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51
3.0
57
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12
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15
24
28
1.95
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13
2.0
13
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0
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23
23
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100
0
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0
0
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1.9
23
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29
2
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61
1.34
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12
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0
25
0
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16
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0
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0
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28
2.0
28
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0
112
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14
2.1
15
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6
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6
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26
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2.4
27
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26
1
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0
302
12
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90
4.3
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9
304
25
6
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1.65
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90
3.7
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361
25
6
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51
1.67
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2.7
47
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0
225
23
20
28
27
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7608315--7608419
21
4.9
21
75
16
99
26
11
0
61
1.29
7608339--7608413
23
3.1
27
77
16
69
26
9
0
64
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7608314--7608453
40
3.2
40
76
16
120
26
12
0
61
1.31
7608339--7608448
47
2.4
47
87
7
154
24
11
0
63
1.28
7608309--7608434
21
5.9
21
71
22
91
25
12
0
61
1.31
7608345--7608429
26
3.5
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22
81
22
12
0
64
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3.4
44
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7
199
37
3
11
48
1.56
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46
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337
21
22
14
40
1.90
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3.0
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0
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0
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263
23
29
19
27
1.98
7615375--7615681
93
3.3
89
80
11
266
23
28
19
28
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356