Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  78  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24528916--24528990
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38
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0
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0
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1.61
24530209--24530247
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0
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48
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1.61
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2.0
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2.0
232
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0
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1.9
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19
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18
88
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0
18
42
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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27
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189
2.0
189
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21
26
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75
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1
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1
25
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21
2.2
21
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2
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40
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114
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1.58
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54
3.2
54
86
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218
46
15
2
35
1.60
24594300--24594460
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3.4
45
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16
1
35
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24
24
1.99
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10
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32
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2.0
21
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2
0
30
1.04
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2.5
20
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53
10
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28
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.99
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5
185
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19
23
28
1.98
24603383--24603532
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1.9
82
84
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207
29
19
23
28
1.98
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15
2.5
15
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0
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2.0
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1.53
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23
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1.60
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24
0
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0
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0
33
33
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24651202--24651365
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23
0
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0
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0
10
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1.34
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26
1.9
25
84
12
64
55
0
10
34
1.34
24675912--24676005
46
2.0
46
100
0
188
27
25
10
36
1.89
24676265--24676298
17
2.0
17
100
0
68
35
23
11
29
1.90
24682028--24682071
20
2.2
20
84
8
54
25
0
4
70
1.06
24689930--24689964
14
2.4
15
85
9
54
42
0
0
57
0.99
24693024--24693050
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
24694008--24694060
26
2.1
25
82
6
63
47
0
5
47
1.26
24695240--24695296
29
2.0
29
92
0
96
24
3
14
57
1.52
24695935--24695978
22
2.1
20
84
16
54
36
2
0
61
1.09
24696819--24696871
22
2.3
23
81
12
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58
3
3
33
1.34
24711931--24711962
10
3.2
10
95
0
55
56
9
25
9
1.61
24716283--24716321
6
6.5
6
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0
60
48
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23
1.79
24718526--24718555
3
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3
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0
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0
33
0
0.92
24719116--24719173
30
1.9
30
92
0
98
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12
3
27
1.51
24721545--24721569
5
5.0
5
100
0
50
0
0
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80
0.72
24722436--24722475
21
1.9
21
89
0
62
25
30
25
20
1.99
24722831--24722861
13
2.3
14
94
5
55
16
9
16
58
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24725215--24725262
20
2.5
20
86
3
62
64
2
6
27
1.28
24725286--24725315
15
2.0
15
93
0
51
40
10
0
50
1.36
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16
2.5
17
82
14
52
61
2
0
35
1.09
24727889--24727939
24
2.1
24
89
7
77
37
5
35
21
1.78
24729787--24729884
19
5.2
19
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7
164
37
10
16
35
1.82
24729777--24729884
36
2.9
35
78
20
112
37
10
15
36
1.82
24730389--24730438
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2.0
25
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20
6
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1.40
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44
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24
27
1.96
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5.4
132
94
0
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31
16
24
27
1.96
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19
5.8
19
87
9
156
37
10
15
36
1.82
24737651--24737758
36
2.9
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103
38
10
14
36
1.80
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19
2.4
19
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47
29
0
22
1.51
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19
3.7
19
83
9
83
36
0
5
57
1.22
24773415--24773485
20
3.7
20
83
9
85
36
0
5
57
1.22
24782181--24782236
27
2.1
27
100
0
112
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1.88
24782739--24782770
3
10.7
3
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0
55
3
34
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2.2
18
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4
51
42
0
0
57
0.98
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15
2.1
15
93
0
53
16
19
9
54
1.68
24798001--24798051
22
2.4
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57
66
3
1
27
1.20
24800868--24800928
30
2.0
30
96
0
113
19
21
16
42
1.89
24804480--24804567
21
4.0
23
81
10
103
38
23
21
15
1.92
24804481--24804568
44
2.0
42
84
4
113
37
23
21
17
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24805471--24805511
22
1.9
21
90
5
64
12
12
2
73
1.20
24805709--24805765
23
2.5
23
83
13
73
36
12
5
45
1.64
24805998--24806059
3
21.3
3
76
12
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4
0
33
1.17
24813009--24813047
20
2.0
20
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10
53
58
7
12
20
1.58
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16
2.1
16
100
0
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26
0
26
1.53
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2.0
28
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32
25
0
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24825124--24825190
31
2.1
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86
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0
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0
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2.0
33
83
11
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1
1
37
1.16
24835438--24835482
12
3.9
11
82
8
54
46
13
17
22
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356