Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   

This is table  164  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
53221437--53221591
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2.2
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20
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1.87
53241484--53242267
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4
1167
33
8
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1.87
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36
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0
117
33
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2.0
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14
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18
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17
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26
13
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
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(0-2)
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2.0
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2.5
105
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1.91
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1.98
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20
27
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28
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2.1
37
90
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1.98
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49
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2
383
28
29
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1.87
53322239--53322512
96
2.9
96
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6
387
28
29
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32
1.87
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3.6
40
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256
23
23
28
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2.1
21
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40
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4
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26
23
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
23
2.00
53367851--53367995
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3.6
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193
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24
25
2.00
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2.2
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101
15
20
36
26
1.93
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29
2.0
29
100
0
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20
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1.89
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11
17
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1.87
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29
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21
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1.98
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0
5
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
53437187--53437220
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
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14
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0
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0
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13
58
1.59
53445605--53445648
23
2.0
21
82
8
52
65
2
2
29
1.16
53447225--53447708
241
2.0
241
94
0
844
26
15
24
34
1.95
53456985--53457112
63
2.0
63
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0
175
35
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53464218--53464511
148
2.0
148
90
0
462
38
13
12
35
1.83
53467691--53467745
28
2.0
27
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10
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5
0
54
1.23
53468795--53468824
9
3.3
9
95
0
51
56
3
0
40
1.16
53474595--53474642
16
3.1
15
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6
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64
2
2
31
1.16
53474591--53474646
24
2.3
24
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1
1
30
1.12
53474591--53474642
8
6.5
8
82
8
61
65
1
1
30
1.14
53474682--53474727
25
1.9
24
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52
6
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1.58
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2.3
24
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51
7
7
33
1.58
53474732--53474804
32
2.4
31
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58
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1.36
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0
2
37
1.10
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5
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1.38
53474850--53474899
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2.2
23
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0
4
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53475387--53475561
30
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0
305
21
3
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25
1.65
53476269--53476454
75
2.5
75
88
4
261
32
21
19
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
206
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1.94
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4.7
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31
1.91
53476516--53476829
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4.2
72
88
7
414
35
18
14
31
1.91
53476477--53476818
149
2.3
151
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460
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19
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1.92
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11
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1.93
53492770--53492837
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1.93
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2.0
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10
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10
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2.0
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0
196
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2.3
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1.63
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22
0
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0
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4.0
251
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2
1426
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2.0
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2.2
22
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0
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1.07
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24
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28
0
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1.05
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129
2.0
129
96
0
482
37
18
15
27
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
53536774--53536906
44
3.0
44
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0
257
32
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1.83
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44
2.5
44
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1
128
26
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35
1.94
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22
2.3
23
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26
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3.8
17
70
17
53
32
0
3
64
1.10

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356