Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  114316535

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   

This is table  62  of  356  ( 42641 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19818154--19818220
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28
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2.0
21
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69
0
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1
1
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1.11
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0
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47
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15
20
32
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.56
19908674--19908784
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71
17
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0
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41
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5
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19911045--19911103
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0
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2.1
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33
0
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16
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
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63
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5
0
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1.11
19931613--19931670
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5
48
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22
20
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589
37
15
21
25
1.92
19940941--19941539
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5.3
112
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37
15
21
25
1.92
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26
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1.97
19963552--19963834
18
15.3
18
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11
133
36
14
12
36
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19963633--19963834
72
2.8
72
77
6
178
37
15
11
35
1.83
19963637--19963834
36
5.5
35
73
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148
37
15
11
35
1.83
19964003--19964174
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45
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43
21
15
19
1.88
19964002--19964174
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21
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19
1.88
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14
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3
61
72
0
11
16
1.13
19968561--19968719
53
3.0
53
79
11
143
20
19
19
40
1.91
19968624--19968748
53
2.4
53
88
0
178
19
19
21
40
1.92
19968856--19969009
80
1.9
80
83
7
197
35
12
14
37
1.83
19968819--19969022
18
10.9
18
72
10
133
36
11
13
38
1.82
19970640--19970721
26
3.2
26
76
11
71
56
3
2
37
1.30
19970695--19970742
22
2.3
21
86
10
64
54
2
2
41
1.24
19972758--19972802
18
2.6
18
82
3
56
17
28
35
17
1.93
19974307--19974372
31
2.1
31
83
5
80
39
6
7
46
1.57
19974474--19974498
10
2.5
10
100
0
50
64
16
8
12
1.49
19975404--19976067
140
4.8
139
82
5
719
31
23
18
27
1.97
19977674--19977713
7
5.6
7
88
5
62
65
2
0
32
1.06
19979290--19979319
15
2.0
15
93
0
51
56
0
0
43
0.99
19980519--19980560
21
2.0
22
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4
59
45
4
2
47
1.36
19980723--19980747
12
2.1
12
100
0
50
32
20
0
48
1.50
19981263--19981334
29
2.5
29
80
8
76
31
4
1
62
1.23
19981264--19981350
20
4.4
19
70
12
52
29
4
1
64
1.21
19981292--19981357
10
6.9
9
75
11
51
27
4
1
66
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19984558--19984655
46
2.1
46
88
0
142
42
23
14
19
1.87
19986884--19987225
174
2.0
173
91
0
549
31
19
9
40
1.82
19993188--19993228
12
3.5
12
81
15
50
2
21
0
75
0.92
19993538--19993621
42
2.0
42
85
0
114
23
39
16
20
1.92
19995874--19995969
31
3.1
31
100
0
192
40
6
19
33
1.77
20000607--20000676
18
4.0
16
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24
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28
2
1
67
1.14
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13
2.2
14
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5
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33
30
10
26
1.89
20002510--20002555
23
2.1
23
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15
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39
0
2
58
1.10
20002510--20002566
23
2.6
24
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13
61
40
3
1
54
1.28
20002610--20002658
24
2.0
25
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7
75
46
4
0
48
1.20
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31
2.1
31
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0
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36
6
7
50
1.56
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25
2.0
24
87
4
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29
6
2
62
1.31
20008802--20008827
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
20018239--20018317
37
2.1
37
88
0
113
25
32
18
22
1.97
20018436--20018964
47
11.1
47
91
2
824
29
30
8
31
1.87
20018438--20018964
96
5.5
96
93
2
859
29
30
8
30
1.87
20018436--20018964
143
3.7
143
92
2
882
29
30
8
31
1.87
20028041--20028216
46
3.8
46
76
12
198
28
28
21
21
1.98
20039978--20040002
12
2.1
12
100
0
50
32
8
16
44
1.76
20045171--20045330
80
2.0
80
97
0
302
43
17
12
26
1.84
20049117--20049151
18
1.9
19
88
11
56
71
0
5
22
1.07
20052892--20052957
31
2.1
32
91
2
107
28
0
18
53
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20052921--20052973
23
2.5
22
85
14
67
28
1
15
54
1.51
20057129--20057332
53
3.8
53
74
4
140
38
17
22
21
1.93
20058637--20058693
27
2.1
27
90
0
87
28
15
17
38
1.91
20059398--20059470
31
2.3
32
83
6
87
41
0
5
53
1.24
20064848--20064929
3
27.0
3
72
11
60
59
4
7
28
1.45
20064849--20064929
15
5.3
15
78
10
76
59
4
7
28
1.46
20064872--20064921
21
2.4
21
93
0
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60
6
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28
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15
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0
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1.21
20065888--20065928
14
2.9
14
86
10
57
82
0
7
9
0.83
20065892--20065929
11
3.5
11
82
13
51
81
0
5
13
0.85

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356