Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  10  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3663825--3663861
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2.1
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0
0
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25
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21
36
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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74
1.9
75
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1
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19
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27
1.98
3715706--3715875
88
1.9
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18
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3.4
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87
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376
26
16
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1.94
3716367--3716905
160
3.4
161
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721
29
18
20
31
1.96
3716506--3716677
88
2.0
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222
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20
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2.0
33
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23
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49
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7
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27
18
24
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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66
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0
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26
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26
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7
70
64
3
3
28
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3817017--3817052
5
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0
0
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20
1.51
3828297--3828406
37
3.0
37
94
1
195
24
21
16
37
1.93
3828370--3828684
52
6.2
52
85
7
393
28
21
13
35
1.92
3828370--3828690
98
3.3
98
82
10
429
29
21
14
34
1.93
3832159--3832251
18
5.2
18
88
0
132
31
17
23
27
1.97
3832159--3832251
36
2.6
36
91
0
150
31
17
23
27
1.97
3834585--3834626
18
2.2
20
83
8
52
45
0
2
52
1.13
3838928--3838978
21
2.4
22
80
9
61
45
0
1
52
1.12
3838950--3839025
24
3.0
24
80
14
82
42
0
1
56
1.07
3839596--3839648
3
17.7
3
92
7
90
0
32
1
66
1.03
3851340--3851388
21
2.3
21
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6
64
59
2
2
36
1.21
3853711--3853778
9
7.6
9
83
0
73
45
22
7
25
1.77
3853841--3853875
18
1.9
18
94
0
61
8
2
48
40
1.49
3854057--3854095
18
2.2
18
85
0
51
33
20
17
28
1.96
3855883--3856037
78
2.0
78
97
0
292
33
19
14
32
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3880988--3881171
59
3.2
59
92
3
311
26
47
3
22
1.66
3881001--3881174
29
6.0
29
89
3
271
27
47
2
22
1.65
3881766--3881870
29
3.8
28
74
10
90
33
5
4
56
1.44
3881837--3881895
25
2.5
24
78
10
68
33
8
6
50
1.59
3881853--3881901
25
2.0
25
91
0
80
34
8
6
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1.57
3883611--3883646
12
3.0
12
95
0
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30
25
2
41
1.69
3891951--3892205
73
3.5
73
91
0
404
30
16
20
31
1.95
3892224--3892252
14
2.1
14
100
0
58
13
13
6
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1.45
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73
2.9
73
91
2
337
27
16
22
33
1.96
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14
2.0
14
100
0
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14
21
7
57
1.61
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73
3.0
73
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4
299
28
16
20
34
1.95
3892704--3892731
14
2.0
14
100
0
56
14
21
7
57
1.61
3892629--3892812
91
2.1
86
84
7
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26
16
19
38
1.92
3892736--3892961
75
3.0
73
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5
292
28
16
21
33
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238
4.0
238
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0
1637
27
17
21
34
1.95
3892938--3892979
14
2.9
15
85
7
59
14
14
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1.48
3892941--3892990
14
3.6
14
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7
57
20
12
4
64
1.43
3893738--3893971
30
7.8
30
88
1
321
26
47
3
22
1.68
3893738--3893971
119
2.0
120
89
2
364
26
47
3
22
1.68
3893738--3893971
89
2.6
88
86
4
308
26
47
3
22
1.68
3894457--3894586
25
5.5
23
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21
65
35
4
2
57
1.32
3894522--3894607
25
3.4
25
74
3
66
37
5
1
55
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3894459--3894604
50
3.1
48
78
12
142
36
4
2
57
1.29
3894830--3894877
16
3.1
15
90
6
69
31
2
2
64
1.16
3894830--3894881
8
6.5
8
82
8
61
30
1
1
65
1.14
3898908--3898935
6
4.7
6
100
0
56
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0
0
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0.94
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24
2.1
24
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0
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11
9
1
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1.10
3901726--3901774
7
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7
77
13
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2
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0.99
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19
2.0
19
100
0
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15
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46
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237
36
15
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89
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212
31
18
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28
1.97
3910163--3910277
44
2.6
45
76
2
124
30
21
20
27
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344