Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  52  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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G
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
Indels
Score
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61
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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25
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21
1.98
17370704--17370818
44
2.6
43
80
10
117
27
26
19
26
1.99
17370937--17371008
28
2.6
28
88
0
99
29
27
12
30
1.93
17381257--17381411
72
2.2
72
92
0
256
30
21
19
27
1.98
17381833--17381884
21
2.4
21
80
3
59
26
3
23
46
1.69
17382083--17382195
35
3.2
34
74
10
102
26
0
36
37
1.57
17382083--17382196
7
16.1
7
71
8
70
26
0
36
36
1.57
17382551--17382637
43
2.0
44
82
10
108
37
33
5
22
1.78
17384950--17384984
16
2.2
16
94
0
61
28
11
20
40
1.87
17386124--17386160
15
2.5
15
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0
56
21
10
18
48
1.78
17387494--17387621
43
3.0
43
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2
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28
17
25
28
1.98
17391018--17391475
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15
17
38
1.90
17400081--17400228
49
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50
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8
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1.96
17400155--17400232
25
3.1
25
70
14
70
28
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16
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1.95
17413403--17413427
9
2.8
9
100
0
50
36
8
0
56
1.29
17414274--17414300
3
9.0
3
100
0
54
66
0
0
33
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17423077--17423263
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41
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3
254
33
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16
22
1.96
17423076--17423263
81
2.3
81
90
1
288
32
28
16
22
1.95
17423910--17423937
13
2.2
13
100
0
56
28
21
28
21
1.99
17425267--17425320
28
1.9
28
88
0
81
59
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3
25
1.48
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32
2.0
32
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43
7
10
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1.68
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20
2.2
21
88
8
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29
18
6
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1.75
17431355--17431406
20
2.6
19
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28
15
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1.73
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22
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0
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1.67
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36
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1.78
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46
3.6
46
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13
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29
29
19
20
1.97
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1.8
93
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0
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20
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1.98
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30
2.0
30
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0
93
30
25
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36
1.85
17461134--17461305
93
1.8
93
95
2
310
28
29
20
20
1.98
17461127--17461302
46
3.8
46
79
14
209
29
29
20
20
1.98
17461723--17461782
30
2.0
30
90
0
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30
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1.85
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209
39
4
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1.70
17471745--17471991
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74
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2
264
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37
18
1.73
17474145--17474258
27
4.2
27
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160
35
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22
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1.95
17474364--17474437
28
2.8
26
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4
85
31
9
22
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1.86
17475762--17475869
26
4.2
26
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0
189
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1.83
17477190--17477219
15
2.0
15
100
0
60
20
6
33
40
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17477405--17477447
9
4.8
9
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8
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4
9
0
86
0.71
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50
2.6
49
89
3
181
30
29
16
23
1.97
17478984--17479170
101
1.9
99
84
4
250
28
28
17
24
1.97
17481396--17481425
6
5.0
6
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0
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3
0
16
0.85
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0
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1.79
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20
1.78
17494157--17494202
20
2.3
20
85
7
58
17
19
2
60
1.46

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344