Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  16  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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Period
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Copy
Number
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Indels
Score
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12
0
35
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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12
28
33
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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35
1.72
5910823--5910874
3
17.0
3
76
11
52
63
3
3
28
1.30
5910786--5910874
6
14.7
6
70
11
56
60
4
6
28
1.42
5910970--5911024
23
2.4
23
82
14
69
52
0
14
32
1.42
5914080--5914106
14
1.9
14
100
0
54
29
18
22
29
1.97
5914802--5914850
11
4.5
11
80
16
57
63
2
0
34
1.06
5914805--5914842
12
3.3
12
85
7
53
71
2
0
26
1.00
5926638--5926921
59
4.8
56
68
16
173
43
1
4
49
1.34
5926638--5926921
120
2.4
115
84
8
385
43
1
4
49
1.34
5926865--5926901
19
2.0
19
85
15
51
45
0
0
54
1.00
5927066--5927156
45
2.0
45
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2
121
37
28
6
27
1.82
5927137--5927189
16
3.2
16
94
5
97
37
37
0
24
1.56
5930615--5930673
31
1.9
31
89
6
93
49
8
10
32
1.67
5933919--5933957
21
1.9
20
84
5
51
10
12
33
43
1.77
5935494--5935552
30
2.0
30
86
0
82
55
13
3
27
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5936176--5936234
29
2.0
30
93
3
102
27
3
16
52
1.60
5936961--5936993
13
2.6
13
90
4
50
42
0
3
54
1.15
5941979--5942179
106
1.9
106
95
0
366
30
18
20
30
1.97
5944892--5945686
44
18.1
43
77
8
764
29
25
16
27
1.97
5944892--5945691
132
6.1
132
96
1
1412
29
25
16
28
1.97
5957020--5957220
106
1.9
106
96
0
375
30
19
20
29
1.97
5972569--5972769
106
1.9
106
96
0
375
30
18
19
30
1.96
5985531--5985604
33
2.3
33
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11
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62
0
0
37
0.96
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17
2.1
16
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11
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30
0
0
69
0.88
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2.4
22
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21
0
7
70
1.12
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26
2.0
24
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8
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0
4
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1.15
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44
2.0
44
100
0
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15
13
22
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39
2.1
39
100
0
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12
17
30
1.86
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1.9
31
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102
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5
25
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23
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4
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37
0
0
62
0.95
5997776--5997952
82
2.1
83
85
3
232
23
19
25
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1.98
5997795--5997952
40
3.9
42
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12
168
24
21
25
29
1.99
5998120--5998672
132
4.2
132
95
0
926
28
26
16
28
1.97
5998115--5998672
88
6.3
87
76
6
502
29
26
16
27
1.97
5998756--5998949
46
4.3
46
67
10
148
30
24
20
25
1.98
5998680--5999017
134
2.5
134
93
0
577
28
23
21
26
1.99
5998921--5999078
45
3.4
45
66
17
124
29
24
18
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5998919--5999114
95
2.0
96
95
1
349
29
22
18
29
1.97
6003319--6003362
19
2.3
20
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7
56
40
11
20
27
1.86
6007616--6007792
82
2.1
83
85
3
232
23
19
25
31
1.98
6007635--6007792
40
3.9
42
76
12
168
24
21
25
29
1.99
6007960--6008512
132
4.2
132
95
0
926
28
26
16
28
1.97
6007955--6008512
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502
29
26
16
27
1.97
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4.3
46
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10
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20
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1.98
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1.99
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28
23
19
28
1.98
6008759--6009049
95
3.0
95
97
1
546
28
23
19
29
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344