Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  199  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66494555--66494586
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50
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2.5
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10
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50
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0
2
59
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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0
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0
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0
0
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0
0
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0
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1.44
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6
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30
2.4
30
90
0
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23
19
27
1.98
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24
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1
0
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51
0
0
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1
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5.0
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21
1.95
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10.0
44
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8
282
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20
21
21
1.95
66579714--66580151
88
5.0
86
89
2
554
36
20
21
21
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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68
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2
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104
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25
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34
1.91
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2.0
28
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11
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46
0
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48
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2.0
24
100
0
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41
8
4
45
1.53
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2.7
11
94
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13
0
13
73
1.10
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50
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15
18
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30
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1.97
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89
8.8
89
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5
719
30
18
22
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66596531--66597324
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18
22
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1.97
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17.0
3
100
0
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0
0
66
0.92
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104
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25
18
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1.97
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26
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0
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30
1.81
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29
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1.81
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0
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42
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9
26
1.83
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31
2.0
30
87
6
88
34
9
13
42
1.77
66620449--66620549
42
2.4
42
86
0
139
20
18
37
22
1.94
66620349--66620652
146
2.1
146
80
1
340
22
19
31
26
1.98
66630739--66630833
40
2.4
39
83
8
113
36
37
12
12
1.82
66631172--66631216
18
2.6
18
89
3
65
13
44
31
11
1.78
66638331--66638398
33
2.1
33
97
0
127
17
35
22
25
1.95
66639051--66639080
5
5.8
5
96
4
51
76
0
23
0
0.78
66643619--66643704
45
1.9
44
88
2
127
25
13
24
36
1.93
66648175--66648206
16
2.0
16
93
0
55
43
3
6
46
1.44
66649429--66649478
20
2.4
21
80
12
59
50
12
4
34
1.58
66651736--66651829
34
2.8
33
80
6
100
58
2
5
34
1.32
66651769--66651824
14
3.7
15
81
13
69
58
1
5
33
1.31
66651791--66651834
14
3.4
13
87
9
63
59
0
4
36
1.18
66651934--66652106
7
25.6
7
69
17
82
61
1
4
33
1.22
66651945--66652044
32
3.1
31
80
8
94
59
2
3
36
1.24
66651985--66652061
34
2.3
34
79
4
84
62
2
3
31
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66651966--66652087
44
2.6
47
76
19
123
61
1
4
32
1.25
66652073--66652137
22
3.2
19
75
16
58
61
3
6
29
1.35
66651934--66652130
87
2.3
88
79
9
192
60
2
4
32
1.27
66653802--66654456
288
2.3
289
91
1
1089
30
21
17
31
1.96
66654272--66654578
131
2.5
118
79
8
344
28
23
18
29
1.98
66654580--66654784
43
4.8
43
69
16
115
23
21
21
33
1.97
66654585--66654784
87
2.3
83
85
9
244
24
21
22
32
1.98
66654625--66654784
87
1.8
87
89
2
250
25
20
21
33
1.97
66666691--66666784
34
2.8
34
80
9
104
59
2
4
34
1.29
66666724--66666779
14
3.7
15
81
13
69
58
1
5
33
1.31
66666746--66666789
14
3.4
13
87
9
63
59
0
4
36
1.18
66666889--66667063
7
25.6
7
70
15
100
61
1
3
34
1.20
66666900--66667063
61
2.7
58
75
17
149
60
1
3
34
1.22
66666928--66667087
87
1.8
86
80
7
189
61
2
3
32
1.27
66667052--66667119
27
2.5
26
74
9
64
61
5
5
26
1.42
66671602--66671754
43
3.6
43
72
10
125
27
15
22
33
1.95
66671690--66671772
43
1.9
43
81
13
100
24
16
25
33
1.96
66677453--66677711
46
5.5
47
80
11
257
27
19
30
22
1.98
66677453--66677769
94
3.4
92
81
10
290
26
19
30
23
1.98
66677491--66677765
46
5.8
50
78
13
172
25
18
30
24
1.98
66685061--66685151
46
2.0
46
100
0
182
37
10
14
37
1.81
66686874--66686920
19
2.4
20
82
13
62
68
0
6
25
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66687208--66687250
19
2.3
19
84
8
52
48
0
6
44
1.29
66687462--66687497
8
4.5
8
100
0
72
50
25
0
25
1.50
66688430--66688460
15
2.1
15
100
0
62
19
0
25
54
1.44
66692623--66692655
17
1.9
17
88
11
50
60
3
0
36
1.12
66692771--66692804
16
2.1
17
88
5
52
64
0
2
32
1.08
66692771--66692805
17
2.1
17
88
0
52
65
0
2
31
1.07
66693194--66693224
14
2.2
14
94
0
53
22
9
32
35
1.87
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100
0
260
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1.62
66701620--66701695
37
2.1
37
94
0
134
30
7
21
40
1.81
66704737--66705079
149
2.4
137
84
7
425
24
12
11
51
1.72

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344