Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  248  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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22
23
33
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.92
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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22
21
27
28
1.99
82617470--82617611
52
2.9
52
80
8
156
30
26
19
23
1.98
82620392--82620443
15
3.5
15
84
2
61
57
15
15
11
1.65
82620419--82620449
15
2.1
15
93
0
53
58
19
9
12
1.62
82624277--82624380
52
2.0
52
88
3
156
31
24
17
26
1.97
82630469--82630549
34
2.4
34
85
2
108
28
18
20
32
1.97
82634086--82634186
48
2.1
48
94
0
175
24
28
15
30
1.96
82635757--82635852
40
2.4
40
84
1
122
50
6
23
19
1.71
82637196--82637282
42
2.1
42
95
0
156
25
16
33
25
1.96
82638721--82638766
16
2.6
17
86
10
58
23
8
6
60
1.49
82639468--82639767
129
2.3
129
81
5
311
26
19
18
36
1.94
82645588--82645812
40
5.6
40
79
5
229
27
27
21
23
1.99
82645588--82645812
83
2.8
81
80
8
253
27
27
21
23
1.99
82645588--82645806
123
1.8
119
85
4
303
27
28
21
23
1.99
82653948--82654171
40
5.6
40
85
4
299
25
28
22
22
1.99
82653948--82654171
83
2.8
80
85
4
292
25
28
22
22
1.99
82661211--82661267
24
2.5
23
78
13
55
22
15
5
56
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82662113--82662188
27
2.7
27
76
11
75
53
5
1
39
1.32
82662346--82662378
7
4.9
7
85
7
50
54
0
0
45
0.99
82662639--82662672
17
1.9
18
88
5
52
50
0
0
50
1.00
82676534--82676609
36
2.1
35
85
7
100
25
31
18
25
1.97
82676723--82677083
47
7.6
47
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8
443
30
28
8
32
1.87
82676723--82677083
95
3.8
94
91
5
568
30
28
8
32
1.87
82676723--82677083
142
2.5
140
92
4
575
30
28
8
32
1.87
82676994--82677072
25
3.3
25
68
10
83
35
27
3
32
1.75
82688690--82688945
40
6.4
40
93
4
369
26
28
22
22
1.99
82696745--82696969
40
5.6
40
84
4
283
26
28
22
23
1.99
82696745--82696969
83
2.8
80
84
4
283
26
28
22
23
1.99
82723093--82723184
48
1.9
48
88
4
141
40
7
28
23
1.82
82727845--82727870
3
8.7
3
100
0
52
30
0
0
69
0.89
82728008--82728053
15
3.1
15
90
0
65
28
10
2
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1.43
82730741--82730833
27
3.4
27
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14
73
34
2
4
59
1.29
82743409--82743506
19
5.2
19
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7
146
38
10
14
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1.80
82743412--82743506
36
2.5
36
91
6
145
38
10
13
36
1.80
82748904--82748950
10
4.7
10
81
7
51
87
0
6
6
0.68
82749813--82750902
132
8.4
132
94
1
1881
31
17
24
26
1.97
82751479--82751540
19
3.2
19
95
4
106
37
9
17
35
1.83
82754001--82754041
19
2.2
19
86
8
57
68
0
7
24
1.15
82754318--82754347
5
6.0
5
92
0
51
76
0
0
23
0.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82754415--82754540
3
42.3
3
74
1
101
63
1
6
28
1.28
82758287--82758337
18
2.6
21
85
11
65
72
0
27
0
0.85
82758297--82758339
16
2.8
15
82
6
59
74
0
25
0
0.82
82758297--82758339
15
2.8
16
86
6
63
74
0
25
0
0.82
82760715--82760782
34
2.0
34
85
0
91
32
27
4
35
1.77
82762184--82762240
24
2.4
24
78
0
60
38
7
14
40
1.73
82764205--82764257
19
2.7
19
77
16
54
43
11
7
37
1.69
82764540--82764587
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2.0
24
95
0
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25
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27
2.00
82765760--82765828
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2.0
34
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0
129
34
1
5
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1.31
82770908--82771100
97
2.0
96
86
3
271
27
25
15
31
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          337   338   339   340   341   342   343   344