Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   

This is table  201  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67051407--67051501
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2.1
44
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1
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32
1.79
67051663--67051697
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54
0
0
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0.99
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2.7
27
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2
0
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3
2
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1.34
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18
2.0
17
88
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54
0
0
45
0.99
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2
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1.43
67051822--67052009
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3.1
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1.9
120
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0
0
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2.0
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0
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2.1
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44
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20
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60
44
0
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1.12
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0
0
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2
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2.0
22
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11
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1.42
67087421--67087524
47
2.3
47
85
6
133
57
4
4
32
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67087653--67087710
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3
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0
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41
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0
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18
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2.8
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0
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1.20
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2.0
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2.1
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100
0
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31
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6
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2.5
290
98
0
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12
37
1.83
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9
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2.2
31
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0
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80
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48
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13
29
1.73
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20
2.0
20
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53
32
5
7
55
1.50
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272
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1
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19
30
1.95
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179
1.9
179
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12
22
1.91
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10.6
47
93
0
802
29
30
8
31
1.87
67124345--67124844
192
2.6
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2
806
29
30
8
31
1.87
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4.7
40
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245
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27
22
25
2.00
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10.6
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1
779
29
29
8
32
1.87
67140703--67140744
20
2.2
19
91
4
66
71
2
23
2
1.10
67141058--67141167
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2.0
53
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5
175
40
9
16
34
1.80
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12.0
3
100
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0
0
0.92
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2.3
30
73
17
70
26
22
1
50
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
27
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25
23
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1.60
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25
2.3
25
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5
73
25
20
24
29
1.99
67175093--67175167
25
3.0
25
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30
18
18
32
1.95
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25
4.7
25
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27
23
23
26
2.00
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2.1
21
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18
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2.2
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30
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15
25
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1.95
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19
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37
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2
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1.13
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19
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54
60
6
2
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1.35
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2.3
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33
24
1
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2.0
20
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31
28
7
32
1.85
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23
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15
24
1.95
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37
2.1
37
85
0
104
26
31
16
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67253930--67254754
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17.7
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8
32
1.87
67253930--67254753
93
8.8
93
95
2
1453
30
28
8
32
1.87
67253930--67254753
231
3.5
233
95
2
1487
30
28
8
32
1.87
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25
3.3
25
64
10
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34
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5
32
1.79
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31
28
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1.88
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10
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35
27
3
32
1.75
67259135--67259160
11
2.4
11
100
0
52
38
0
0
61
0.96
67260371--67260497
47
2.7
47
82
3
141
26
14
25
32
1.95
67264863--67264893
16
1.9
16
93
0
53
41
0
22
35
1.54
67265612--67265742
65
2.0
65
100
0
262
38
6
14
41
1.71
67272258--67272288
16
1.9
16
93
0
53
41
0
22
35
1.54
67279797--67279878
25
3.3
23
91
3
92
29
18
20
31
1.96
67281561--67281599
13
3.0
13
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0
51
17
33
30
17
1.94
67281643--67281672
12
2.5
12
94
0
51
16
30
30
23
1.96
67283605--67283830
112
2.0
113
97
0
427
34
15
4
46
1.66
67287901--67287953
27
2.0
27
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0
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20
26
5
47
1.72
67288971--67289013
21
2.0
21
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0
50
53
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0
27
1.45
67290000--67290070
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2.0
35
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0
133
54
11
7
26
1.61
67293225--67293268
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1.9
23
90
0
70
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4
2
31
1.28
67293229--67293271
11
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11
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17
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2
2
30
1.18
67294958--67294982
13
1.9
13
100
0
50
40
24
0
36
1.55
67296340--67296404
22
3.0
22
76
0
67
38
16
16
27
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67300073--67300136
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4.2
16
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9
71
51
0
1
46
1.10
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20
2.1
21
86
4
61
27
11
2
58
1.46
67305642--67305691
25
2.0
25
84
7
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48
2
2
48
1.24
67312562--67312763
40
5.0
41
88
3
272
26
26
22
24
2.00
67325276--67325332
25
2.3
25
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0
96
28
17
15
38
1.91
67330660--67330700
19
2.2
19
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8
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39
14
7
39
1.74
67339490--67339544
24
2.2
26
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12
71
45
0
1
52
1.11
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2.1
45
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1
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1.79
67339757--67339808
16
3.2
16
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0
86
34
36
0
28
1.58
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33
2.2
33
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7
87
52
16
5
26
1.65
67360111--67360151
20
2.0
20
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0
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2.0
14
100
0
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28
7
21
1.79
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43
4.5
42
79
9
183
27
15
27
30
1.96
67376399--67376589
43
4.4
43
76
9
183
27
15
27
29
1.96
67379733--67379941
41
5.1
41
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5
221
37
22
20
19
1.94
67379764--67379941
81
2.2
81
85
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227
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20
18
1.94
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7.7
7
78
0
54
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0
25
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1.50
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21
3.9
21
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11
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28
1
25
44
1.61
67380117--67380206
46
2.0
46
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0
171
30
2
25
42
1.67
67380233--67380360
7
18.1
7
69
9
55
22
0
39
37
1.54
67381155--67381234
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2.0
41
82
0
97
42
13
12
31
1.82
67382776--67382825
12
4.2
12
73
14
50
34
0
24
42
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67382784--67382829
23
2.0
23
87
8
67
30
0
23
45
1.53
67382827--67382861
2
17.5
2
100
0
70
0
0
48
51
1.00
67383221--67383760
23
23.4
23
76
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433
34
5
22
37
1.78
67383231--67383758
46
11.4
46
84
4
609
34
5
22
37
1.78
67383243--67383758
139
3.7
138
89
2
662
34
5
22
37
1.78
67385642--67385688
19
2.5
19
76
10
51
21
2
4
72
1.12
67386172--67386210
18
2.2
18
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0
51
43
0
5
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0
1
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1
265
22
22
29
25
1.99
67400767--67400947
39
4.6
39
88
1
247
23
21
29
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344