Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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This is table  305  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100893590--100893627
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20
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4.5
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24
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19
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65
26
51
32
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17
32
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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2.5
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0
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30
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18
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0
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24
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0
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4.4
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8
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24
26
19
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100988350--100988527
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1.98
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0
5
12
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207
26
14
28
30
1.95
100999788--100999968
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2.2
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202
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14
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1.95
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175
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19
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28
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21
21
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.2
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15
32
1.84
101049553--101049631
19
3.8
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18
86
39
10
15
35
1.81
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2.2
14
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19
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3
70
1.22
101055456--101055508
24
2.4
22
78
12
63
20
20
15
43
1.88
101058366--101058418
6
9.2
6
89
6
83
32
16
0
50
1.46
101058746--101058790
19
2.4
19
85
3
65
48
4
2
44
1.35
101061954--101061992
19
2.0
20
90
9
64
17
10
5
66
1.39
101070479--101070815
167
2.0
167
99
0
665
30
16
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28
1.97
101074036--101074094
31
1.9
30
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3
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16
1.88
101081401--101081868
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5.0
93
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2
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26
25
15
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101086360--101086398
20
2.0
20
85
9
55
46
7
10
35
1.67
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11
4.9
11
88
2
63
32
3
45
18
1.68
101092144--101092218
36
2.1
36
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0
123
37
13
18
30
1.89
101092140--101092212
18
4.1
18
80
0
83
38
12
16
32
1.86
101092753--101092799
11
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44
19
1.70
101093057--101093092
17
2.1
17
100
0
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0
36
1.54
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16
8
1.57
101099670--101099723
24
2.3
24
77
3
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3
16
3
75
1.08
101099798--101099822
13
1.9
13
100
0
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4
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16
2.1
16
100
0
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44
0
5
50
1.26
101100610--101100644
17
2.1
17
88
0
52
40
0
2
57
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101100575--101100671
21
4.5
21
73
12
81
36
1
4
58
1.24
101100577--101100673
38
2.3
40
80
16
101
36
1
4
58
1.24
101100629--101100700
35
2.0
36
89
2
110
34
4
5
55
1.42
101100663--101100743
23
3.4
23
81
11
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2
4
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1.35
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58
2.2
57
83
12
170
37
2
4
55
1.34
101100663--101100767
48
2.2
47
79
14
110
36
2
4
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1.35
101100777--101101142
24
16.0
23
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4
6
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1.46
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4
56
1.49
101101414--101101472
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3.2
18
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30
3
1
64
1.20
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2.0
20
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4
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45
2
0
52
1.14
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2.5
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32
1.80
101106116--101106182
34
1.9
35
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14
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1
1
29
1.09
101111671--101111761
37
2.4
38
87
1
139
48
32
5
13
1.65
101111777--101111881
39
2.7
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1
167
48
21
6
22
1.73
101113877--101114079
64
3.2
64
93
0
345
45
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15
23
1.84
101114171--101114223
6
9.2
6
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15
67
64
16
0
18
1.30
101114176--101114275
18
5.7
18
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10
82
55
15
5
25
1.60
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3
115.0
3
65
26
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32
3
1
62
1.22
101118827--101119183
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38
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23
120
32
3
1
62
1.21
101118895--101119130
7
33.1
7
68
20
125
34
2
1
61
1.18
101118893--101119175
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21
163
33
3
1
61
1.20
101118927--101119022
50
1.9
51
85
10
135
34
3
0
62
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101118898--101119182
21
13.1
22
70
21
106
33
3
1
61
1.22
101118895--101119178
102
2.7
104
73
20
239
33
3
1
61
1.20
101118900--101119220
149
2.2
145
78
12
316
33
3
2
61
1.26
101119421--101119487
17
3.9
17
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50
32
2
0
64
1.09
101123289--101123344
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5
7
10
1.14
101123317--101123362
12
3.8
12
85
0
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78
4
4
13
1.05
101123329--101123371
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2.5
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2
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0.95
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0
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2
1.14
101125242--101125284
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11
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0
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2
1.13
101128736--101128782
6
7.7
6
79
11
51
76
2
4
17
1.04

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344