Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  280  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94025217--94025278
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12
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0
1
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0
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2.0
33
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0
1
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18
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10
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23
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1.57
94051204--94051455
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4.8
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2
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1.57
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5.5
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254
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2
13
47
1.58
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5.8
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20
90
52
0
1
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1.08
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2.9
29
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3.0
24
93
0
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19
28
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.57
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0
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21
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20
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22
1.92
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25
2.0
25
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2.0
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177
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26
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188
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21
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0
5
33
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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1.40
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0
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0
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1.80
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3.0
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3.1
63
82
1
201
29
30
17
22
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94164700--94164872
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2
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23
1.96
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27
3.9
27
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33
21
25
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1.97
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25
3.2
26
91
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37
23
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32
1.80
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1.21
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23
19
1.96
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3.2
26
98
0
155
34
26
8
30
1.86
94198921--94199017
40
2.4
40
87
0
131
31
18
24
24
1.97
94203597--94203634
19
2.0
20
85
15
53
39
23
0
36
1.55
94203863--94204030
46
3.6
45
78
12
180
29
28
20
22
1.98
94203864--94204034
93
1.8
93
92
0
288
29
28
20
21
1.98
94204452--94204511
30
2.0
30
90
0
93
31
25
5
38
1.77
94211179--94211216
19
2.0
20
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15
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39
23
0
36
1.55
94211446--94211616
93
1.8
93
89
0
270
30
28
19
21
1.97
94211441--94211611
46
3.7
46
75
10
168
30
28
18
22
1.97
94212036--94212095
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2.0
30
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0
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25
5
38
1.77
94215381--94215422
18
2.5
18
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11
54
33
0
4
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1.17
94216651--94216699
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22
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6
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0
75
1.00
94218473--94218758
144
2.0
144
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0
554
30
20
12
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1.90
94218985--94219022
19
2.0
19
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0
58
26
31
23
18
1.97
94218989--94219031
19
2.3
19
79
0
50
30
30
18
20
1.97
94222937--94223048
41
2.7
43
84
5
149
22
16
24
36
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94228358--94228571
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2.0
107
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1
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26
15
12
45
1.81
94234721--94235185
234
2.0
234
97
0
876
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18
15
29
1.91
94242798--94242838
14
3.1
14
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20
52
17
36
0
46
1.48
94243372--94243417
22
2.2
22
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7
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58
0
4
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1.18
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42
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0
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28
19
26
1.99
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37
2.0
37
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0
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1.99
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2.2
16
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0
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1.61
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18
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0
2
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1.12
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25
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0
100
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16
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2.7
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0
137
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25
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1.96
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21
2.0
22
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1.63
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35
22
23
17
1.95
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4.2
26
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0
184
36
24
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1.79
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234
2.0
234
99
0
912
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1.91
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28
2.7
28
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2
105
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22
9
33
1.87
94295045--94295090
22
2.2
22
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58
0
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2.0
56
100
0
224
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1.9
21
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0
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15
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20
57
1.61
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49
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7
161
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24
25
1.98
94313325--94313584
142
1.8
144
80
10
318
27
19
25
26
1.99
94314369--94314404
13
2.8
13
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13
19
41
25
1.88
94320572--94320627
28
2.0
28
86
10
78
16
16
46
21
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94320744--94320783
21
2.0
20
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5
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15
37
27
20
1.92
94322724--94322805
34
2.5
33
80
11
96
67
0
20
12
1.23
94322792--94322831
21
2.0
20
85
5
53
57
5
30
7
1.48
94322817--94322895
18
4.4
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73
17
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56
1
26
15
1.46
94322783--94322897
37
3.1
37
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101
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1
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13
1.44
94327465--94327540
27
2.8
26
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4
116
31
5
32
30
1.80
94330486--94330535
18
2.8
18
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2
2
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21
1.98
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2.1
29
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0
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23
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30
1.95
94354055--94354142
28
3.1
29
79
10
94
37
21
20
20
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344