Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   

This is table  272  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90983273--90983324
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2.0
26
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0
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2.1
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2.0
30
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0
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26
2.0
26
96
0
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2.2
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18
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31
1.95
90990689--90990838
70
2.1
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1
239
23
15
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31
1.95
90990799--90990850
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2.0
26
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0
77
15
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30
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2.4
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5
86
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3
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1.33
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74
0
2
22
0.94
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60
72
0
2
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29
2.5
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94
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0
2
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0.95
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2.0
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28
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28
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21
1.99
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1.8
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264
28
29
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20
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80
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0
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57
67
0
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23
1.17
91015911--91015947
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2.8
13
87
4
56
43
13
0
43
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
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0
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2.8
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0
0
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0.97
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2.0
25
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2
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1.43
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2
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5
0
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4
0
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91027504--91027565
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23
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2.1
24
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23
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20
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2.9
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55
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29
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65
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5
21.8
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100
0
218
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0
40
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2.2
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94
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346
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2.4
19
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58
58
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2.0
272
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4.9
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14
173
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19
25
28
1.99
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5.6
40
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283
25
26
22
25
2.00
91080687--91080910
83
2.8
79
85
5
281
25
26
22
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91094355--91094423
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1.9
36
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0
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1.81
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24
2.2
24
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3
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10
1
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1.50
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11
6.7
11
69
24
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42
1
2
53
1.23
91108138--91108245
37
2.9
36
79
16
116
38
2
3
54
1.33
91108138--91108213
11
6.8
11
68
24
52
39
2
2
55
1.28
91110227--91110445
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3.0
74
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2
329
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13
15
48
1.79
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2.0
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2.0
27
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11
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19
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100
0
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23
4
26
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1.73
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24
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67
63
3
3
29
1.28
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30
19
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1.98
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20
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20
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1.98
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1.09
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19
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70
0
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25
1.08
91170742--91170874
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2.7
48
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11
128
71
0
8
20
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91171916--91172027
27
4.1
26
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8
134
37
23
22
16
1.94
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24
3.0
24
91
0
115
25
36
1
36
1.65
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27
4.2
25
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14
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22
20
18
1.93
91179734--91179844
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2.1
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8
127
38
22
20
18
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28
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10
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15
30
27
1.96
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4.7
29
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100
26
17
31
24
1.97
91190156--91190289
28
4.7
28
74
10
110
26
17
30
24
1.97
91193727--91193765
16
2.4
16
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0
51
56
20
12
10
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91203121--91203158
15
2.3
18
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17
55
5
23
0
71
1.07
91203122--91203158
17
2.3
17
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9
60
5
24
0
70
1.08
91206913--91206961
24
2.0
24
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7
82
24
8
16
51
1.71
91216208--91216244
18
2.0
19
94
5
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37
5
21
35
1.77
91216737--91216799
32
2.0
32
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0
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15
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26
1.90
91216795--91217392
69
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69
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1
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26
11
19
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1.85
91216795--91217392
275
2.2
276
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1
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26
11
19
42
1.85
91217130--91217238
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35
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1.79
91225567--91225599
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5.5
6
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0
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2
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1.14
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2.00
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40
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23
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24
2.00
91273413--91273443
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1.9
16
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0
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22
0
3
74
0.96
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12
2.8
12
100
0
66
24
0
27
48
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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1.9
17
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0
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0
0
72
0.85
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9
9.3
9
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16
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24
6
2
66
1.28
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16
2.1
16
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0
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21
3
0
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2.0
25
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1.98
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2.3
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25
1.97
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1.9
100
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1.98
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2.0
21
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20
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150
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14
26
1.94
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1.9
55
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0
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1
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10
5.0
10
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1
11
1
84
0.78
91323715--91323766
21
2.5
20
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9
68
1
11
1
84
0.78
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21
1.9
22
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91334005--91334050
21
2.2
21
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10
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25
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2.3
286
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23
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142
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3.0
22
72
20
59
30
8
23
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2.7
11
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48
0
10
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667
2.6
666
89
2
2675
27
14
14
43
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91345318--91345365
24
2.0
25
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4
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22
4
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62
1.44
91345519--91345561
22
1.9
23
85
4
61
65
2
2
30
1.18
91350481--91350656
46
3.8
45
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194
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20
28
28
1.98
91350477--91350648
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1.8
93
92
0
290
21
20
29
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1.98
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5
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5
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0
0
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0
0
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14
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115
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2
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2.0
30
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0
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22
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1.84
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43
2.6
43
88
0
170
12
26
31
29
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344