Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  268  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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1.99
Indices
Period
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Score
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220
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2.0
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13
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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Score
A
C
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(0-2)
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53
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4
34
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89528404--89528630
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1.99
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0
56
85
0
0
14
0.59
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155
3.0
155
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2
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46
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13
25
1.81
89601226--89601351
55
2.3
55
81
10
150
25
26
30
17
1.97
89616523--89616578
16
3.5
16
95
0
103
14
12
23
50
1.77
89616523--89616578
8
7.0
8
74
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55
14
12
23
50
1.77
89621181--89621221
21
2.0
21
90
0
64
39
14
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34
1.84
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37
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4
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89624160--89624202
16
2.7
16
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0
77
9
6
11
72
1.29
89627533--89627718
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4.7
40
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25
26
2.00
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2
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27
1.99
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16
2.0
16
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1.52
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0
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17
2.1
17
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25
17
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51
1.67
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40
2.0
41
95
2
150
32
10
3
53
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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36
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23
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0
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24
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14
2.1
14
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0
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0
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2.0
50
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202
23
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1.79
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37
20.3
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1.92
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22
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1.92
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1.95
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2.9
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2
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15
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33
0
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2.2
23
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23
2.0
23
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1.68
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59
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44
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23
22
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2.1
47
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21
20
25
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1.98
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2.1
55
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28
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2.0
32
100
0
130
43
21
9
26
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89749232--89749306
21
3.6
21
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14
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0
15
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2.0
63
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0
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254
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24
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89777570--89777651
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0
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0
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0
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2.5
20
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10
64
64
0
35
0
0.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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