Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  49  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
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Percent
Indels
Score
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16
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68
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19
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3.4
29
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2
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12
22
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1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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25
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222
22
28
21
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16491353--16491405
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1.9
20
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51
12
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2.2
20
86
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59
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26
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50
50
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18
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9
39
1.48
16503610--16503655
17
2.5
19
82
10
60
32
0
2
65
1.05
16518590--16518864
48
5.8
48
68
14
167
27
25
20
27
1.99
16520286--16520373
29
3.0
29
86
3
122
36
12
26
25
1.91
16520259--16520371
59
1.9
59
85
3
156
37
12
25
24
1.91
16527005--16527038
9
3.8
9
88
0
50
52
2
11
32
1.53
16527516--16527547
10
3.0
11
90
9
57
56
0
25
18
1.42
16538729--16538776
25
2.0
24
84
12
62
64
2
12
20
1.37
16538770--16538803
17
1.9
18
88
5
52
73
0
5
20
1.04
16552687--16552716
15
2.0
15
93
0
51
43
56
0
0
0.99
16555419--16555484
28
2.4
28
84
2
89
33
22
24
19
1.97
16568412--16568452
22
1.9
22
90
5
66
12
43
26
17
1.84
16576669--16576735
33
2.0
33
91
0
107
29
5
28
35
1.81
16577668--16577746
39
2.0
39
95
0
140
39
22
22
15
1.91
16578547--16578603
27
2.1
28
93
3
98
35
3
8
52
1.50
16580488--16580517
11
2.7
11
94
0
51
10
40
26
23
1.86
16589356--16589391
17
2.1
18
89
5
56
69
0
0
30
0.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16589369--16589412
13
3.4
12
87
12
61
72
0
2
25
0.96
16589411--16589454
13
3.5
13
75
6
54
45
0
0
54
0.99
16589404--16589455
25
2.1
25
100
0
104
46
0
0
53
1.00
16590023--16590063
12
3.6
12
80
12
50
21
0
0
78
0.76
16590285--16590349
33
2.0
33
90
6
105
63
12
13
10
1.53
16591176--16591228
16
3.3
16
75
0
61
1
15
3
79
0.96
16598356--16598574
117
1.9
116
85
2
305
28
23
13
34
1.93
16600192--16600226
14
2.4
15
85
9
54
31
8
22
37
1.85
16604401--16604426
11
2.4
11
100
0
52
57
0
30
11
1.34
16612898--16613040
43
3.3
42
87
3
180
28
21
22
27
1.99
16613397--16613444
21
2.3
20
80
16
53
4
47
18
29
1.67
16613411--16613504
42
2.2
42
85
7
129
3
51
17
28
1.61
16613441--16613505
18
3.4
18
75
12
51
3
52
16
27
1.59
16613420--16613501
21
3.9
21
84
6
96
2
51
18
28
1.59
16619061--16619181
9
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9
69
12
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33
2
20
42
1.65
16619135--16619366
56
4.2
56
89
5
348
34
0
16
48
1.50
16619135--16619345
113
1.9
112
93
3
361
33
0
17
48
1.51
16619291--16619320
13
2.3
13
100
0
60
36
0
10
53
1.35
16619323--16619353
9
3.4
9
90
0
53
29
0
19
51
1.47
16619428--16619492
20
3.0
20
72
20
67
38
6
16
38
1.74
16621746--16621875
60
2.2
60
84
4
165
36
3
40
20
1.70
16621958--16622439
114
4.2
115
80
7
451
37
23
14
25
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16623342--16623430
41
2.2
41
83
4
108
21
17
20
40
1.92
16623403--16623457
28
2.0
28
88
0
83
21
21
20
36
1.95
16623422--16623527
40
2.7
40
85
2
133
19
18
22
38
1.93
16626505--16626544
16
2.5
16
84
11
55
72
10
2
15
1.21
16630191--16630238
23
2.1
23
100
0
96
29
4
25
41
1.74
16643704--16643873
52
3.3
52
83
6
181
30
12
27
29
1.93
16643704--16643881
51
3.5
51
83
4
209
30
14
26
28
1.95
16652682--16652706
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4.2
6
100
0
50
68
0
0
32
0.90
16658284--16658324
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2.3
19
87
8
59
34
0
7
58
1.26
16662268--16662387
40
3.3
40
66
26
120
25
15
25
34
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344