Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  308  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101720435--101720476
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0
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2.0
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0
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1
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1.20
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40
2
0
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2
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1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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12
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101788665--101788886
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26
28
13
31
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101788972--101789818
210
4.1
209
87
4
1158
30
22
18
28
1.97
101788972--101789818
415
2.0
418
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4
1194
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22
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101797775--101797801
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1.9
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0
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0
51
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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2.0
26
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53
4
2
40
1.32
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4.1
39
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29
22
3
44
1.70
101802284--101802421
39
3.6
39
88
1
199
30
18
3
47
1.66
101802268--101802421
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2.0
78
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2.0
20
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20
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25
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1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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30
4
0
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1.13
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0
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1.12
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17
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4
4
63
1.34
101854860--101854911
23
2.2
24
83
10
63
26
9
3
59
1.46
101857056--101857114
26
2.3
26
87
0
82
38
8
20
32
1.83
101859601--101859654
26
2.1
26
100
0
108
29
11
14
44
1.80
101867974--101868020
23
2.0
23
88
8
69
12
27
6
53
1.63
101875057--101875081
5
5.0
5
100
0
50
20
0
0
80
0.72
101882930--101883041
59
1.9
57
85
8
156
33
13
16
36
1.88
101883047--101883112
33
2.0
33
87
0
96
34
18
12
34
1.88
101885098--101885140
18
2.3
19
92
4
70
46
9
9
34
1.68
101885113--101885147
18
1.9
18
88
0
52
42
17
5
34
1.73
101887409--101887497
26
3.6
24
75
11
74
12
25
22
39
1.89
101887534--101887601
24
2.9
24
74
10
68
23
25
14
36
1.93
101887809--101887834
10
2.6
10
100
0
52
23
7
7
61
1.49
101895244--101895325
29
2.8
29
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0
137
47
4
0
47
1.23
101899568--101899618
24
2.1
24
100
0
102
27
7
3
60
1.42
101900196--101900235
19
2.1
19
90
0
62
32
0
0
67
0.91
101903359--101903405
21
2.2
22
92
3
78
21
19
38
21
1.94
101906874--101907131
129
2.0
129
100
0
516
31
15
26
27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101908403--101908444
21
2.0
22
85
4
59
54
0
9
35
1.33
101910101--101910296
91
2.2
91
87
1
286
28
16
23
31
1.96
101910195--101910796
132
4.5
132
88
2
814
26
15
24
33
1.95
101910674--101910914
130
1.9
130
85
1
340
27
17
22
32
1.96
101911024--101911081
7
8.0
7
80
5
62
18
1
37
41
1.61
101911234--101911331
15
6.6
14
74
13
63
18
2
31
47
1.60
101911238--101911311
29
2.6
29
73
16
80
18
1
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44
1.59
101911296--101911349
15
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15
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18
1
33
46
1.60
101915213--101915346
46
2.8
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13
152
22
18
28
30
1.97
101922230--101922262
17
1.9
17
93
0
57
6
3
24
66
1.28
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37
10.7
35
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9
208
30
20
12
36
1.90
101926585--101926910
75
4.4
75
74
7
213
30
21
12
35
1.91
101934370--101934417
25
2.0
24
83
4
60
22
4
8
64
1.38
101936369--101936433
28
2.3
27
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7
76
61
0
9
29
1.27
101948246--101948285
21
2.0
20
85
5
53
72
0
7
20
1.08
101948677--101948709
4
8.2
4
100
0
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24
24
0
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1.48
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22
2.4
22
75
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54
15
9
15
60
1.58
101950001--101950030
15
2.0
15
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0
51
30
0
0
70
0.88
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39
2.1
39
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2
144
43
12
17
26
1.84
101951915--101951941
4
6.8
4
100
0
54
0
22
0
77
0.76
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11
3.7
11
80
0
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19
14
9
56
1.66
101965087--101965115
14
2.0
15
93
6
51
41
0
31
27
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101965047--101965122
40
1.9
40
94
5
136
34
3
31
30
1.76
101993975--101994007
4
8.2
4
100
0
66
24
24
0
51
1.48
101994202--101994254
22
2.4
22
75
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54
15
9
15
60
1.58
101996558--101996638
39
2.1
39
97
0
153
43
12
17
27
1.84
101997264--101997290
4
6.8
4
100
0
54
0
22
0
77
0.76
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2.0
13
100
0
52
0
0
23
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0.78
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3.7
11
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0
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1.66
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0
0
31
0.90
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3.5
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80
18
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21
16
15
46
1.84
102009310--102009406
42
2.3
44
80
7
103
19
19
15
45
1.86

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344