Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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This is table  15  of  344  ( 41197 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5444498--5444553
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14
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5450209--5450294
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114
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20
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0
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16
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0
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27
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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2.9
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5583137--5583255
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8.1
15
72
21
67
26
6
1
65
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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22
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0
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1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
5633082--5633109
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49
93
0
232
23
13
30
32
1.94
5662358--5662729
46
8.5
44
80
16
307
34
14
22
28
1.93
5662299--5662656
46
7.6
48
83
12
431
34
14
22
29
1.93
5662299--5662645
142
2.4
142
94
2
597
34
14
21
29
1.93
5662313--5662656
187
1.8
189
89
4
539
34
13
22
29
1.93
5662620--5662727
37
3.0
37
90
5
177
36
16
22
25
1.94
5667599--5667644
20
2.3
20
75
17
51
54
4
0
41
1.20
5669824--5669856
11
3.1
11
82
8
50
57
3
0
39
1.14
5674592--5674640
24
2.0
24
100
0
98
34
24
8
32
1.85
5695695--5695735
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
5708689--5708719
12
2.6
12
94
0
53
0
25
0
74
0.82
5709971--5710010
21
2.0
20
85
5
53
47
27
0
25
1.52
5711144--5711258
27
4.3
26
85
5
140
36
22
23
17
1.95
5711144--5711258
54
2.1
54
87
3
160
36
22
23
17
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5711364--5711434
28
2.7
26
86
4
88
32
11
22
33
1.90
5712876--5712985
26
4.2
26
95
0
175
36
23
5
34
1.78
5727036--5727154
58
2.1
58
96
0
220
22
15
23
37
1.93
5728320--5728529
106
2.0
106
96
0
384
34
9
22
33
1.87
5737372--5737419
25
1.9
25
91
0
78
39
6
8
45
1.59
5743090--5743127
20
1.9
20
94
0
67
63
0
0
36
0.95
5746684--5746835
78
1.9
78
94
0
268
36
23
16
24
1.94
5749727--5749760
6
5.7
6
100
0
68
0
17
0
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0.67
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30
2.1
30
82
17
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48
0
0
51
1.00
5751469--5751518
19
2.7
18
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11
57
44
0
0
56
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10
3.0
10
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0
51
50
6
0
43
1.28
5755230--5755378
3
50.0
3
70
15
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4
2
28
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5755282--5755372
14
7.1
12
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22
62
64
1
3
30
1.16
5755282--5755379
17
6.1
16
76
15
80
64
2
3
30
1.20
5755749--5755787
17
2.3
17
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20
0
51
28
1.48
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22
2.0
22
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4
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46
4
0
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1.22
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29
2.0
29
100
0
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13
13
31
1.84
5762355--5762411
28
2.1
27
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3
78
45
12
8
33
1.72
5762778--5762851
29
2.5
29
86
4
94
21
14
16
47
1.82
5763817--5763888
29
2.4
29
86
4
90
48
16
13
20
1.80
5765953--5766001
20
2.5
20
80
12
64
24
14
10
51
1.73
5766801--5766826
11
2.4
11
100
0
52
46
11
0
42
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5767625--5767659
18
1.9
18
88
0
52
42
8
5
42
1.59
5767758--5767782
3
8.3
3
100
0
50
64
0
0
36
0.94
5769298--5769377
32
2.5
32
83
4
99
52
18
2
26
1.58
5774695--5774760
28
2.3
29
86
5
89
56
24
6
13
1.60
5785243--5785433
3
65.0
3
67
6
95
30
7
2
59
1.38
5785402--5785428
14
1.9
14
100
0
54
29
7
3
59
1.42
5785456--5785490
15
2.4
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4
52
25
5
0
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1.11
5785546--5785592
14
2.9
17
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27
6
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1.39
5785778--5785870
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2.1
44
100
0
186
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24
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1.82
5791031--5791055
6
4.2
6
100
0
50
48
0
0
52
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344