Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  48  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16022565--16022624
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30
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2.1
19
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21
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1.8
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93
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21
21
29
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3.7
46
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199
21
21
28
28
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30
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2
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1
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2.4
46
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2
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1
15
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2.3
110
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15
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1.56
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235
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35
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4.3
209
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35
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3.2
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20
176
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2
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99
96
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4
5
37
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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70
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1.9
23
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4
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1.30
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2.0
181
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16
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22
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100
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20
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1.9
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100
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29
40
14
14
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621
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19
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17
2.5
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23
0
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50
64
1
0
33
1.04
16117209--16117252
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2.4
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81
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56
2
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4.2
26
97
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207
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2.5
22
81
13
62
19
8
5
66
1.39
16140130--16140237
26
4.2
26
97
0
198
30
5
26
37
1.79
16141830--16141970
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2.6
53
90
2
219
17
23
23
35
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16141830--16141970
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5.2
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23
23
35
1.95
16141830--16141988
27
5.9
27
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11
175
18
23
22
35
1.96
16142937--16142976
18
2.2
17
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60
5
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32
1.32
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5.2
26
96
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241
31
5
26
35
1.81
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27
5.2
26
80
6
156
19
22
22
35
1.96
16148659--16148799
54
2.6
53
92
2
219
19
22
22
35
1.96
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19
2.6
18
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53
50
6
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1.27
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18
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51
8
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1.32
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2
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1.21
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29
1.99
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26
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0
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2.1
47
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0
146
29
23
14
34
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16193828--16193914
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2.0
44
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4
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24
25
13
36
1.92
16194454--16194511
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1.99
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0
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4
20
32
1.73
16202212--16202310
50
2.0
50
82
4
119
32
14
12
41
1.82
16206667--16206710
12
3.6
12
84
6
52
34
20
4
40
1.73
16206667--16206714
25
1.9
25
91
0
78
35
18
4
41
1.70
16211338--16211388
25
2.0
25
88
0
75
35
17
7
39
1.79
16211707--16211740
3
11.3
3
93
0
59
0
38
0
61
0.96
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7
3.9
7
100
0
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29
0
0
70
0.88
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67
2.7
67
98
0
344
51
20
7
20
1.71
16230421--16230452
16
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17
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34
0
0
65
0.93
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18
2.2
19
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42
0
5
52
1.23
16231351--16231392
15
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16
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4
4
26
1.33
16232651--16232690
9
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0
2
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0
1
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18
1.9
18
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2
2
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1.29
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11
3.7
11
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0
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19
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16234139--16234172
11
3.0
12
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12
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0
0
32
0.91
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3
14.3
3
84
13
56
64
4
28
2
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16235581--16235628
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2.1
23
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29
2
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1.56
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30
2.1
30
100
0
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39
15
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20
2.4
20
85
3
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76
2
2
19
0.99
16246106--16246156
21
2.5
20
75
9
50
74
7
1
15
1.13
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20
2.3
20
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2
4
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1.31
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16
3.2
16
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38
0
2
59
1.09
16247469--16247536
30
2.3
30
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0
2
60
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0
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2.0
20
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0
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0
10
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62
0
1
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2.3
70
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206
53
4
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1.31
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17
2.0
18
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0
5
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70
2.1
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0
0
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2.1
19
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0
0
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17
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60
0
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36
1.13
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2.2
30
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0
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19
19
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19
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0
0
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2.5
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64
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6
0
26
1.14
16253328--16253376
20
2.5
19
83
9
55
67
6
0
26
1.14
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29
2.1
29
82
14
74
60
3
0
36
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16253463--16253524
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0
0
43
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1
0
40
1.05
16253469--16253529
21
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59
1
0
39
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16253487--16253566
35
2.2
34
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8
115
58
1
0
40
1.06
16253520--16253575
22
2.4
24
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80
55
5
0
39
1.23
16253520--16253584
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0
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2
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5.4
5
100
0
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0
0
59
0.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344