Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  14  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5083772--5083816
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0
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3.9
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3.2
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3.2
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3.4
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3.2
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17
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10
100
0
50
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0
12
24
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
0
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20
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1
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1.20
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45
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93
0
420
39
15
19
25
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5173417--5173459
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2.0
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2.1
23
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16
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14
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2.7
15
85
7
55
51
0
7
41
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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21
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4
0
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5212256--5212312
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2.5
22
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0
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4.3
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22
14
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1.93
5231022--5231290
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2.7
98
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0
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31
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12
81
27
18
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1.67
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27
2.1
27
96
0
103
25
10
28
35
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5261257--5261302
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2.9
15
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67
0
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1.15
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5.0
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64
0
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20
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12
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52
75
9
6
9
1.18
5272747--5273221
48
9.9
48
95
0
851
34
6
28
30
1.83
5273362--5273464
37
2.8
37
95
0
179
23
19
32
25
1.98
5275623--5275830
40
5.2
40
82
8
237
24
21
27
25
1.99
5275680--5275834
79
2.0
79
85
10
210
25
21
28
25
1.99
5285497--5285704
106
2.0
106
81
3
249
22
33
18
25
1.97
5286666--5286705
21
1.9
21
100
0
80
22
35
10
32
1.87
5293071--5293106
18
2.1
18
94
5
65
41
16
19
22
1.90
5297503--5297539
16
2.3
17
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9
60
37
16
0
45
1.47
5297903--5297941
20
1.9
20
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5
51
5
23
25
46
1.73
5314107--5314138
16
2.0
16
100
0
64
18
12
31
37
1.88
5322178--5322213
16
2.2
16
90
9
56
58
8
11
22
1.59
5322527--5322573
3
15.7
3
81
0
58
61
0
6
31
1.21
5322730--5322820
3
30.3
3
71
18
57
60
2
4
32
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5324262--5324324
31
2.0
32
84
9
85
47
0
4
47
1.23
5329331--5329651
86
3.7
88
79
12
322
20
21
22
35
1.96
5338790--5338829
6
6.7
6
100
0
80
15
15
17
52
1.75
5338993--5339288
18
16.1
18
72
11
161
35
12
15
37
1.84
5338993--5339159
72
2.3
72
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7
187
37
11
14
36
1.83
5340936--5341141
75
2.7
75
85
5
283
32
20
20
26
1.97
5340922--5341179
75
3.4
75
82
4
279
30
21
23
24
1.99
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45
2.9
45
94
0
219
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13
24
23
1.91
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22
3.1
22
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18
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24
1.92
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3.3
45
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1
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39
13
24
22
1.90
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27
3.5
27
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2
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14
16
22
1.84
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27
3.4
27
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5
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44
17
18
20
1.87
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1.9
21
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14
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53
0
21
24
1.46
5359661--5359730
13
5.3
13
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1
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37
24
2
35
1.70
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19
22
15
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5360372--5360420
23
2.1
23
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20
16
1.93
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23
5.0
23
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14
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33
23
26
16
1.95
5362275--5362304
15
2.0
15
100
0
60
33
13
26
26
1.93
5377619--5377644
6
4.3
6
100
0
52
15
34
15
34
1.89
5383800--5383858
31
1.9
31
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13
77
38
10
15
35
1.81
5384338--5384395
28
2.1
28
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0
107
55
22
1
20
1.53
5385570--5385661
39
2.4
39
86
0
121
31
20
15
32
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5404751--5404786
18
2.1
17
94
5
63
52
5
16
25
1.65
5405914--5405966
20
2.6
21
81
6
63
62
1
7
28
1.33
5415373--5415404
16
2.0
16
100
0
64
37
31
18
12
1.88
5416715--5416758
22
2.0
21
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4
70
65
0
0
34
0.93
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22
2.0
22
86
4
61
69
0
0
30
0.88
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23
1.9
22
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13
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62
6
4
25
1.40
5429066--5429125
21
2.9
21
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1
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1
0
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0
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0
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1.20
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18
3.7
18
75
0
62
34
17
11
35
1.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344