Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  41  of  344  ( 41197 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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1.89
Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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28
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28
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1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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16
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56
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
13868040--13868121
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27
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27
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1.85
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6
83
16
53
66
0
0
33
0.92
13883176--13883230
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2.5
22
82
2
67
16
29
36
18
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13884125--13884169
17
2.5
17
92
7
72
68
2
6
22
1.24
13885562--13885590
9
3.0
10
90
10
51
58
0
20
20
1.39
13885853--13885924
26
2.8
26
83
10
94
38
9
16
34
1.82
13901519--13901560
21
2.0
21
100
0
84
38
9
4
47
1.57
13906682--13906714
11
2.8
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50
51
9
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33
1.58
13909645--13909875
48
4.9
48
76
10
217
29
24
19
26
1.98
13910716--13910776
13
4.7
13
85
0
86
37
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24
1.84
13910713--13910776
26
2.5
26
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0
110
35
28
7
28
1.85
13912231--13912355
43
2.9
44
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35
25
14
24
1.93
13913644--13913675
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15
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15
1.36
13917860--13917894
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0
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11
5
0
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0.82
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29
3.0
28
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14
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29
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24
1.94
13919947--13920057
58
1.9
58
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1
143
30
28
15
25
1.96
13919956--13920070
29
4.0
29
78
2
117
31
27
14
26
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13922807--13922849
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2.3
18
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11
52
18
0
30
51
1.47
13933395--13933626
120
1.9
120
93
0
401
29
20
13
36
1.91
13951774--13952003
48
4.9
48
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11
240
28
25
18
27
1.98
13954639--13954753
27
4.3
26
85
5
140
36
22
23
17
1.95
13954639--13954753
54
2.1
54
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36
22
23
17
1.95
13956371--13956428
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2.2
26
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0
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1.78
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57
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1.96
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1.92
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1.84
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27
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1.83
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1
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0
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0
0
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0.92
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2.4
26
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30
2.1
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3
3
38
1.32
13989544--13989645
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2.0
52
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0
38
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10
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8
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52
0
0
47
1.00
13992916--13992961
20
2.2
21
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18
60
52
0
0
47
1.00
13997154--13997205
24
2.2
24
100
0
104
34
13
19
32
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13998038--13998142
35
3.1
33
67
20
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56
1
9
32
1.43
13997993--13998160
66
2.5
65
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196
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1
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27
1.34
13998074--13998266
73
2.6
72
78
4
192
58
3
7
30
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13999694--13999994
44
6.7
44
74
6
188
31
20
14
33
1.92
13999810--13999908
51
1.9
51
87
4
146
33
18
11
37
1.86
13999685--13999947
89
2.9
89
80
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244
32
22
12
32
1.92
14001237--14001275
19
2.0
20
90
5
62
43
5
23
28
1.75
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2.0
34
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29
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20
1.99
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4.3
25
69
0
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25
1.98
14017839--14017964
50
2.5
50
84
0
153
30
18
26
25
1.98
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1.97
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3.2
58
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20
200
52
5
2
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1.39
14033949--14034000
27
2.0
26
84
3
68
36
19
25
19
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344