Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  37  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Period
Size
Copy
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Indels
Score
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132
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27
1.98
12465747--12466935
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20
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1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
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1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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29
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0
189
25
23
17
34
1.96
12585990--12586023
11
3.0
12
87
12
54
32
0
0
67
0.91
12589266--12589299
14
2.4
14
90
5
50
47
0
0
52
1.00
12612503--12613125
310
2.0
310
97
0
1167
21
20
13
44
1.86
12619489--12619515
6
4.5
6
100
0
54
48
14
0
37
1.45
12621258--12621305
20
2.4
20
83
10
62
54
0
0
45
0.99
12625755--12625786
15
2.1
15
94
0
55
65
6
9
18
1.42
12625853--12625909
26
2.2
26
87
6
80
29
14
17
38
1.89
12626458--12626775
155
2.1
155
93
1
539
35
15
18
29
1.92
12627819--12627874
21
2.7
21
94
2
96
37
26
7
28
1.83
12630353--12630479
48
2.4
52
83
10
154
42
2
4
50
1.36
12630399--12630517
61
2.0
58
83
4
148
42
2
5
49
1.38
12631205--12631290
43
2.0
43
100
0
172
23
18
32
25
1.97
12634057--12634107
24
2.1
24
85
0
66
47
1
0
50
1.12
12647362--12647441
32
2.5
32
81
4
90
53
18
2
25
1.57
12651228--12651367
50
2.8
50
86
1
181
37
15
22
23
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12651343--12651491
31
4.8
31
90
0
226
28
20
26
25
1.99
12652841--12652877
17
2.2
18
85
9
51
75
2
0
21
0.92
12669360--12669416
18
3.2
18
87
0
87
33
14
22
29
1.93
12673855--12673911
23
2.5
23
100
0
114
40
19
12
28
1.87
12674579--12674667
44
2.0
44
95
0
160
32
14
5
47
1.68
12674747--12674787
20
2.0
20
100
0
82
41
9
9
39
1.71
12676615--12676639
10
2.5
10
100
0
50
12
0
8
80
0.92
12676624--12676661
18
2.2
17
90
4
58
18
0
2
78
0.86
12677827--12677861
18
1.9
18
88
0
52
34
17
14
34
1.90
12677900--12678084
18
10.3
18
75
6
151
37
15
11
35
1.84
12677834--12677949
62
1.9
62
81
1
144
37
15
12
34
1.85
12677807--12678072
54
4.8
54
73
11
173
37
15
12
34
1.85
12678260--12678369
45
2.4
45
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5
150
42
18
17
21
1.89
12678349--12678381
6
5.5
6
96
0
57
45
15
18
21
1.85
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137
2.0
137
95
0
494
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23
17
26
1.97
12681871--12681954
26
3.2
26
96
0
150
36
25
4
33
1.77
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2.4
16
91
0
60
0
30
0
69
0.89
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12
2.8
13
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8
54
22
0
2
74
0.95
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25
2.5
23
78
15
66
56
8
3
31
1.46
12697441--12697479
17
2.4
17
86
4
53
64
7
0
28
1.21
12697472--12697510
17
2.3
17
95
0
69
64
0
10
25
1.25
12697663--12697726
3
21.3
3
100
0
128
67
0
0
32
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12697946--12698026
18
4.5
18
74
11
60
60
4
7
27
1.44
12699588--12699616
14
2.1
14
93
6
51
72
3
0
24
1.00
12700063--12700114
24
2.2
24
85
0
68
36
3
11
48
1.58
12709769--12709813
22
2.0
22
82
0
54
17
8
8
64
1.47
12712063--12712133
22
3.2
23
78
7
67
25
1
11
61
1.37
12712060--12712125
23
3.0
23
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6
82
22
1
13
62
1.40
12715769--12715795
2
13.5
2
100
0
54
0
0
51
48
1.00
12718631--12718682
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2.0
26
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7
36
1.73
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20
2.0
21
85
5
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57
7
2
32
1.40
12719043--12719084
22
1.9
22
85
9
59
45
2
2
50
1.27

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344