Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  231  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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19
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1.96
Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
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Indices
Period
Size
Copy
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Score
A
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(0-2)
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50
2.7
43
74
18
106
30
4
2
61
1.30
76605258--76605301
3
14.0
3
81
9
52
36
0
2
61
1.09
76605359--76605464
9
11.7
9
73
13
74
18
0
0
80
0.77
76605348--76605483
5
27.8
5
69
17
56
20
2
0
76
0.94
76605369--76605431
21
2.9
21
74
9
54
26
1
0
71
0.95
76605345--76605431
43
2.0
44
84
11
115
27
1
0
71
0.93
76605346--76605508
12
13.1
12
74
16
68
23
1
0
74
0.96
76605427--76605460
1
34.0
1
93
0
59
2
0
0
97
0.19
76605424--76605460
13
2.7
14
91
8
67
5
0
0
94
0.30
76605363--76605464
8
12.4
8
77
13
75
18
0
0
80
0.77
76605409--76605520
16
7.3
15
75
15
61
19
2
1
75
1.01
76605346--76605514
72
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70
73
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155
22
1
1
74
0.98
76617305--76618372
74
13.9
74
82
9
1188
30
16
21
31
1.96
76620346--76620404
24
2.5
24
78
10
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35
6
0
57
1.25
76620101--76620383
3
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3
68
20
126
33
5
3
57
1.38
76620415--76620443
13
2.3
13
94
5
51
34
0
0
65
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76620572--76620631
3
19.7
3
86
3
84
33
0
3
63
1.11
76631487--76631658
80
2.2
79
81
7
188
26
20
26
26
1.99
76631483--76631625
40
3.6
40
82
9
175
24
21
27
25
1.99
76631850--76632209
47
7.6
47
91
2
567
32
8
29
29
1.87
76631850--76632209
96
3.8
96
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2
593
32
8
29
29
1.87
76631850--76632209
143
2.5
141
90
3
560
32
8
29
29
1.87
76638744--76638880
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2.2
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21
27
23
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1.99
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5
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0
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20
0
0
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0.73
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49
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29
27
16
26
1.96
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1.8
99
95
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330
29
28
15
26
1.96
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29
2.0
28
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3
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53
3
1
41
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11
3.7
11
100
0
82
17
0
7
75
1.02
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16
1.9
17
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57
21
0
0
78
0.76
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28
2.3
28
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0
112
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27
7
30
1.85
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27
3.2
28
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110
17
24
24
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1.97
76654891--76654981
27
3.2
28
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20
26
20
31
1.98
76654882--76654995
55
2.1
55
81
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133
17
24
22
35
1.95
76655424--76655462
19
2.1
19
85
0
51
15
5
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71
1.26
76657186--76657230
17
2.6
18
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10
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31
8
8
51
1.64
76658599--76658634
12
3.0
12
87
0
54
25
27
5
41
1.77
76658607--76658638
16
1.9
17
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25
28
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40
1.79
76666836--76667118
65
3.9
74
79
11
307
29
18
24
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76666976--76667117
74
1.9
74
88
2
212
30
19
23
26
1.98
76667123--76667286
75
2.1
77
87
6
235
30
18
20
29
1.97
76666974--76667433
167
2.7
166
88
4
640
30
19
20
30
1.97
76667387--76667533
79
1.9
79
80
0
177
33
16
19
31
1.94
76667559--76667607
24
2.0
24
96
0
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32
14
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1.94
76668554--76668601
17
2.7
18
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89
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31
0
4
1.12
76668973--76669021
17
2.8
18
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8
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0
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1.20
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2.0
21
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52
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2
4
37
1.33
76671142--76671172
12
2.7
12
95
5
55
51
6
0
41
1.27

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344