Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  262  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.96
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0
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2.2
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0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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22
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24
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2
27
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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9
43
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
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Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87502158--87502403
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211
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201
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87543568--87543612
20
2.2
20
88
0
63
48
2
11
37
1.51
87551602--87551779
27
6.6
27
85
3
214
30
28
14
26
1.95
87551623--87551778
82
1.9
81
89
3
242
30
28
14
26
1.95
87556735--87556813
25
3.2
25
78
10
81
36
25
11
26
1.90
87556794--87556914
25
4.8
25
71
11
95
34
18
14
33
1.90
87556709--87556839
50
2.6
49
77
6
129
35
23
12
28
1.91
87556752--87556908
76
2.1
76
84
4
201
31
20
13
34
1.91
87556804--87556949
50
2.9
50
82
3
150
33
18
13
34
1.89
87559673--87559898
40
5.7
40
88
4
271
26
26
21
25
1.99
87568920--87568978
16
3.7
16
75
8
57
47
1
1
49
1.21
87582968--87583007
18
2.2
18
86
0
53
30
10
17
42
1.82
87584598--87584663
27
2.5
27
72
2
62
34
22
13
28
1.92
87585899--87585976
39
2.0
39
97
0
147
34
12
21
30
1.91
87588454--87588562
42
2.6
42
77
2
112
32
22
15
30
1.95
87597729--87597849
43
2.8
43
87
0
188
27
12
24
35
1.91
87597728--87597918
86
2.2
86
81
6
226
28
12
23
36
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87597728--87597918
43
4.4
43
73
7
172
28
12
23
36
1.91
87609622--87609839
46
4.7
46
79
10
230
30
27
19
22
1.98
87618826--87618945
43
2.8
42
72
12
118
26
18
25
30
1.98
87630826--87631040
46
4.6
48
80
4
224
24
28
18
28
1.98
87630840--87631040
94
2.1
93
86
5
280
23
28
18
29
1.98
87635643--87635798
43
3.6
42
77
7
161
30
17
22
30
1.96
87637045--87637110
14
4.6
14
74
22
66
16
33
31
18
1.93
87637059--87637116
30
1.9
31
92
3
100
18
27
34
18
1.95
87656509--87656556
21
2.3
21
92
0
78
18
41
27
12
1.86
87657189--87657460
63
4.3
63
77
4
246
23
26
21
27
1.99
87664401--87664475
37
2.1
36
84
2
96
36
14
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40
1.78
87669184--87669222
7
5.4
7
96
3
69
2
25
12
58
1.47
87670625--87670674
20
2.5
21
81
15
61
22
14
2
62
1.42
87672163--87672255
42
2.2
42
80
1
105
29
18
22
30
1.97
87678540--87678597
29
2.0
29
100
0
116
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10
0
58
1.31
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33
2.3
33
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0
100
40
20
10
28
1.86
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5
12.6
5
75
15
62
19
3
0
77
0.90
87681555--87681620
28
2.3
28
87
10
89
19
3
0
77
0.90
87682759--87682947
99
1.9
99
86
2
272
29
12
25
32
1.92
87683604--87683653
10
5.0
10
83
9
66
22
10
2
66
1.32
87684622--87684651
11
2.7
11
94
0
51
40
0
3
56
1.16
87692313--87692347
17
2.1
17
88
0
52
45
5
5
42
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87699749--87699779
16
1.9
16
93
0
53
51
0
0
48
1.00
87699875--87699921
15
3.1
15
81
6
51
31
2
4
61
1.27
87699875--87699922
16
3.1
15
79
8
53
31
2
4
62
1.26
87702713--87702954
50
4.8
50
77
3
225
31
26
16
24
1.97
87702705--87702905
101
2.0
101
91
0
321
29
26
18
24
1.98
87705457--87705533
29
2.6
32
74
15
76
32
6
0
61
1.22
87707777--87707810
14
2.4
14
90
0
50
23
52
11
11
1.70
87715461--87715671
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43
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121
30
18
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26
1.98
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132
2.2
132
97
0
556
28
19
23
28
1.99
87715547--87716002
178
2.6
178
87
1
648
27
20
23
28
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344