Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  31  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Period
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Copy
Number
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93
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29
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
A
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(0-2)
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1.94
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Period
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21
2.3
21
87
9
68
42
0
0
57
0.98
10924749--10924774
12
2.2
12
100
0
52
38
0
0
61
0.96
10925173--10925295
61
2.0
61
93
3
212
39
14
5
39
1.70
10926285--10926313
13
2.2
13
100
0
58
51
6
0
41
1.28
10930930--10931058
23
5.6
23
78
6
109
41
35
3
19
1.67
10930948--10931065
23
5.1
23
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5
130
42
36
3
17
1.66
10933798--10933873
35
2.2
35
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9
84
39
0
5
55
1.23
10934656--10934731
40
1.9
40
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0
107
32
35
15
15
1.90
10941206--10941241
18
1.9
19
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5
56
30
5
0
63
1.17
10947584--10947668
33
2.7
31
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1
31
1
65
1.07
10947804--10947862
11
5.6
10
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16
6
0
76
1.00
10947794--10947852
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1
76
1.05
10947804--10947858
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2.1
26
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12
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16
7
0
76
1.00
10952347--10952900
114
4.9
113
93
1
894
26
20
26
27
1.99
10952347--10952900
227
2.4
228
92
2
916
26
20
26
27
1.99
10952800--10952957
73
2.2
72
88
1
226
26
21
23
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10953311--10953354
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2.7
17
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6
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29
0
27
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10953635--10953672
14
2.7
15
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26
0
28
44
1.54
10953695--10953726
15
2.2
14
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5
55
25
0
37
37
1.56
10953692--10953763
29
2.5
30
69
15
69
25
2
37
34
1.70
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2.2
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3
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48
7
0
43
1.32
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2.1
14
100
0
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0
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1.54
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15
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0
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0
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1.46
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1
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1.20
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2.1
16
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36
0
3
60
1.12
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43
4.3
43
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3
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26
17
27
28
1.97
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2.5
31
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4
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11
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28
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1.86
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2.4
21
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0
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34
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26
1.81
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2
148
32
15
21
30
1.94
10965948--10966022
27
2.9
26
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13
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30
6
0
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1.21
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16
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3
0
64
1.11
10969716--10969758
21
2.0
21
100
0
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20
0
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2.0
22
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13
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76
0
6
16
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48
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48
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11
283
24
31
17
26
1.97
10984251--10984304
27
2.0
27
82
13
67
46
5
1
46
1.37
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54
2.1
54
100
0
222
44
21
12
21
1.85
10993590--10993626
18
2.1
18
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0
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54
13
0
32
1.40
10993850--10993959
34
3.1
34
66
16
89
39
12
4
43
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10993846--10993988
71
2.0
71
97
0
268
39
11
3
44
1.58
10993874--10993999
34
3.6
35
69
15
107
37
8
2
51
1.46
10995683--10995712
16
1.9
15
93
6
51
16
6
0
76
0.99
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27
2.0
27
81
0
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33
7
12
46
1.70
10998922--10998980
25
2.4
24
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5
100
37
5
15
42
1.69
10998928--10998979
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2.1
25
100
0
104
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3
15
42
1.65
11000827--11000932
23
4.6
23
77
13
119
24
18
18
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1.94
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26
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0
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25
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31
1.82
11010616--11010721
22
4.6
22
77
14
99
24
19
18
36
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          337   338   339   340   341   342   343   344