Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  281  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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220
29
19
21
29
1.98
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3.3
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91
0
116
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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2.0
21
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10
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24
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29
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0
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
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Percent
Indels
Score
A
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10
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38
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
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Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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363
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17
29
25
1.98
94560561--94560651
44
2.1
44
87
4
130
47
12
13
27
1.78
94562784--94563056
151
1.8
147
84
4
368
23
37
19
19
1.94
94563531--94563568
7
5.4
7
90
0
58
68
0
31
0
0.90
94564284--94564350
33
2.0
33
97
0
125
46
16
16
20
1.84
94570604--94570656
26
2.0
26
82
13
65
35
1
13
49
1.53
94574038--94574075
7
5.4
7
90
0
58
68
2
28
0
1.03
94575361--94575451
44
2.1
44
93
0
155
47
13
12
27
1.78
94577941--94577968
14
2.0
14
100
0
56
57
14
7
21
1.61
94580603--94580720
57
2.1
58
91
1
193
44
8
20
27
1.80
94599101--94599206
48
2.2
49
81
8
119
21
16
32
29
1.96
94607930--94608094
48
3.5
48
77
6
174
26
26
18
29
1.98
94607930--94608145
94
2.3
94
82
3
265
25
25
18
30
1.98
94613209--94613295
43
2.0
43
97
0
165
48
8
13
29
1.71
94618240--94618323
43
1.9
44
82
2
107
32
29
13
25
1.93
94618283--94618547
47
5.6
47
73
14
204
27
28
16
27
1.97
94618239--94618548
141
2.2
141
90
1
489
27
29
16
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94618461--94618595
49
2.7
50
83
7
177
20
29
19
30
1.97
94619904--94619993
28
3.2
27
86
10
112
33
23
23
20
1.97
94619904--94619993
27
3.2
28
81
13
114
33
23
23
20
1.97
94625529--94625625
27
3.6
27
91
2
149
26
14
28
29
1.95
94625529--94625638
27
4.0
27
87
4
114
29
13
26
30
1.94
94630942--94631011
27
2.5
28
90
4
106
34
22
24
18
1.96
94630942--94631031
27
3.2
27
82
7
101
33
23
23
20
1.97
94631137--94631201
28
2.3
28
94
0
112
30
7
27
33
1.85
94635050--94635147
28
3.5
28
78
0
97
26
26
15
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1.96
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5.5
40
91
0
330
25
22
26
25
2.00
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40
3.5
40
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26
23
27
23
2.00
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49
2.7
48
81
3
145
24
29
19
26
1.98
94651102--94651308
46
4.4
46
76
6
159
24
25
20
29
1.99
94651100--94651308
94
2.2
93
82
3
249
23
26
20
29
1.99
94653194--94653275
33
2.5
33
93
0
137
48
23
3
24
1.67
94654025--94654182
43
3.7
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79
7
158
31
25
18
24
1.98
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61
2.0
61
100
0
244
26
26
11
36
1.90
94661722--94661762
20
2.0
22
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9
59
46
0
0
53
1.00
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23
2.0
23
95
0
81
11
8
66
13
1.44
94674592--94674631
10
4.3
10
78
18
50
45
2
0
52
1.14
94675766--94675806
18
2.2
19
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57
63
2
29
4
1.28
94676945--94677003
21
2.8
22
80
10
70
35
25
23
15
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94678007--94678045
7
5.6
7
93
6
62
58
0
0
41
0.98
94678174--94678215
16
2.7
16
78
14
52
57
0
0
42
0.99
94678529--94678585
23
2.5
23
80
11
64
47
1
1
49
1.22
94685170--94685215
21
2.3
20
78
14
51
45
17
6
30
1.73
94688577--94688619
18
2.3
19
84
4
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2
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13
1.08
94688588--94688646
6
9.8
6
85
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5
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16
1.13
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8
100
0
58
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0
0
37
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196
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0
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1.98
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2.0
18
100
0
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33
16
16
33
1.92
94711517--94711577
19
3.3
19
70
17
56
54
6
1
37
1.37

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344