Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  17  of  344  ( 41197 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6013253--6013296
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3
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1.9
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3
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18
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3
3
27
1.24
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20
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16
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5.7
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77
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23
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17
36
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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6158727--6158816
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1
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0
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19
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1
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104
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31
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6.9
52
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14
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29
1.93
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3.6
98
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2
511
34
13
22
28
1.92
6184494--6184855
150
2.4
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5
571
34
14
22
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1.93
6184832--6185049
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5.9
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38
16
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24
1.93
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3.0
58
87
10
237
22
13
30
33
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.2
28
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25
15
31
27
1.95
6186363--6186505
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2.9
49
93
0
232
23
13
30
32
1.94
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5.4
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18
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14
22
28
1.93
6189642--6189948
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51
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14
22
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1.93
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3.3
98
95
0
563
34
14
22
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1.93
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6.0
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381
37
16
21
24
1.93
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104
2.2
104
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1
378
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31
19
17
1.95
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1.9
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80
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24
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1.82
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29
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1.24
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1
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1.27
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3.8
46
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4
210
21
21
28
28
1.98
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1.8
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93
0
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21
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29
1.98
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2.0
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100
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1.16
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1.88
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30
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22
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1.66
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2.0
26
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7
63
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3
0
48
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6240346--6240390
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2.1
21
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1.47
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19
18
1.70
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39
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18
17
1.69
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16
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7
17
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20
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15
19
1.64
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2.3
79
80
8
196
56
8
16
18
1.64
6240996--6241159
20
8.2
19
68
12
78
57
7
16
17
1.62
6241015--6241195
80
2.2
80
79
6
179
55
9
17
17
1.67
6252109--6252144
17
2.2
17
90
5
56
58
0
0
41
0.98
6252128--6252171
14
3.1
14
80
9
54
50
0
0
50
1.00
6263404--6263532
64
2.0
65
89
1
197
31
18
13
36
1.90
6263843--6263940
45
2.2
45
83
3
117
33
17
21
27
1.96
6263597--6264338
176
4.2
176
89
1
1056
29
19
22
28
1.98
6263597--6264320
353
2.1
352
89
0
1097
29
20
21
29
1.98
6264274--6264470
67
2.9
67
92
0
331
27
20
24
26
1.99
6266104--6266155
14
3.4
14
75
17
50
26
0
7
65
1.20
6266107--6266155
16
3.1
16
80
14
57
28
0
6
65
1.16
6266116--6266149
15
2.3
14
90
10
50
26
0
2
70
1.01
6266290--6266355
25
2.5
25
82
7
69
27
12
7
53
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6266465--6266489
13
1.9
13
100
0
50
24
8
0
68
1.16
6283815--6283875
26
2.3
27
83
5
81
39
21
3
36
1.70
6283813--6283875
13
4.8
13
76
7
65
39
22
3
34
1.70
6283813--6283886
26
2.9
26
76
9
80
40
24
2
32
1.69
6288401--6288497
19
5.1
19
73
12
90
17
25
26
29
1.97
6288886--6288940
27
2.0
27
100
0
110
25
3
21
49
1.66
6290548--6290663
62
1.9
61
80
1
133
23
16
28
31
1.96
6292573--6292639
32
2.1
32
94
0
116
26
29
14
28
1.96
6306730--6306779
25
2.0
25
96
0
91
62
8
18
12
1.53
6310151--6310188
19
2.0
19
100
0
76
36
5
31
26
1.79
6313044--6313075
16
2.0
16
100
0
64
31
18
6
43
1.75
6315211--6315264
2
27.0
2
100
0
108
50
50
0
0
1.00
6315883--6315988
25
4.2
25
72
13
76
34
19
22
22
1.96
6333753--6333833
39
2.1
39
100
0
162
34
22
7
35
1.82
6338320--6338353
17
2.0
17
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0
50
32
35
5
26
1.81
6343562--6343593
15
2.1
15
100
0
64
68
12
6
12
1.37
6347960--6348002
13
3.5
13
75
18
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48
13
0
37
1.43
6347958--6348009
23
2.3
23
96
3
97
48
11
0
40
1.40
6348442--6348472
14
2.2
14
94
0
53
45
9
12
32
1.75
6356478--6356522
22
2.0
22
100
0
90
77
4
4
13
1.07
6356729--6356783
27
2.0
28
82
10
69
32
0
21
45
1.52
6357280--6357382
40
2.6
40
82
0
116
25
13
24
36
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6357370--6357471
28
3.6
28
97
0
186
25
14
28
31
1.95
6359488--6359524
18
2.0
19
89
5
58
72
8
0
18
1.08
6359526--6359578
11
4.6
12
81
4
56
66
5
0
28
1.15
6359617--6359654
17
2.2
17
90
0
58
65
5
2
26
1.27
6361708--6361743
18
2.0
18
100
0
72
27
27
27
16
1.97
6372303--6372404
50
2.0
51
96
1
188
50
12
9
27
1.72
6374907--6374955
23
2.2
22
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3
71
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4
6
22
1.30
6384622--6384684
27
2.4
27
97
2
119
46
22
3
28
1.67
6387801--6387852
19
2.8
19
83
11
63
36
0
17
46
1.48
6390057--6390170
60
1.9
60
87
3
167
33
21
11
33
1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          337   338   339   340   341   342   343   344