Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   

This is table  63  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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21
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1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.49
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25
2.9
24
82
14
79
16
32
0
50
1.45
20548692--20548759
34
1.9
36
94
5
122
45
10
25
19
1.81
20559618--20559647
15
2.0
15
93
0
51
43
0
0
56
0.99
20562485--20562511
6
4.5
6
100
0
54
18
18
14
48
1.82
20569296--20569327
16
2.0
16
100
0
64
43
6
18
31
1.75
20585899--20586018
48
2.5
48
83
2
145
28
22
14
35
1.93
20591639--20591708
34
2.1
34
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0
122
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20
1.97
20592723--20592785
16
3.7
17
83
10
76
41
4
1
52
1.32
20599679--20599717
20
2.0
20
85
10
53
23
0
30
46
1.53
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24
2.1
24
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0
73
34
22
10
34
1.87
20602999--20603023
13
1.9
13
100
0
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0
4
24
1.02
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1.89
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16
2.2
16
100
0
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16
0
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1.12
20619760--20619929
63
2.7
63
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0
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25
23
25
25
2.00
20622359--20622438
23
3.5
23
77
3
81
27
25
15
32
1.95
20622428--20622486
26
2.3
26
84
0
73
28
22
22
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
26
84
0
73
27
23
23
25
2.00
20633746--20633833
20
4.4
20
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13
76
12
28
19
39
1.88
20635136--20635299
42
3.7
42
85
8
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29
27
14
29
1.95
20635171--20635389
91
2.4
93
81
9
252
31
26
13
28
1.94
20635222--20635389
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3.6
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31
26
13
27
1.94
20635411--20635559
31
4.8
31
88
0
217
26
26
19
27
1.99
20635535--20635663
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2
197
24
23
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1.95
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26
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1.95
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26
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29
1.94
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2.3
95
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8
256
30
26
13
29
1.94
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1.9
50
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0
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1.95
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20
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35
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29
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1.90
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32
2.5
32
85
0
108
18
39
22
19
1.92
20658012--20658072
16
4.0
15
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10
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42
0
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54
1.17
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71
6.0
71
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2
473
23
23
22
30
1.99
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35
3.2
35
70
5
102
23
21
24
30
1.99
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36
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35
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2
121
21
22
24
31
1.98
20659528--20659955
213
2.0
213
82
1
527
23
23
22
30
1.99
20659528--20659943
142
2.9
142
85
0
544
23
23
22
30
1.99
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34
2.6
34
80
7
90
21
22
26
29
1.99
20672493--20672573
43
1.9
43
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2
119
28
18
20
32
1.97
20672491--20672592
43
2.4
43
79
14
113
25
18
24
31
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20675709--20675813
43
2.5
42
81
3
129
23
18
25
32
1.97
20678190--20678238
25
2.0
24
92
4
80
34
4
40
20
1.71
20678191--20678246
25
2.2
24
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37
5
37
19
1.75
20679646--20679752
27
3.9
27
78
9
110
19
24
18
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1.94
20679649--20679757
54
2.0
54
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148
20
23
18
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1.94
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25
2.3
25
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36
5
38
19
1.74
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27
4.2
26
85
7
143
16
24
23
36
1.94
20687443--20687554
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2.1
54
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172
16
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1.94
20688885--20688953
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2.0
34
97
0
129
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36
2
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1.70
20694369--20694401
17
2.0
17
88
5
50
6
9
27
57
1.53

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344