Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  216  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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53
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2
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15
1.39
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21
2.0
23
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64
2
15
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1.39
71832835--71832917
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3.9
21
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38
22
21
16
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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46
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0
213
21
25
15
37
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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26
26
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21
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8
52
39
0
2
58
1.11
71907631--71907668
19
2.1
19
85
5
51
28
10
10
50
1.70
71923194--71923241
25
1.9
26
87
8
73
35
8
10
45
1.68
71926189--71926213
6
4.2
6
100
0
50
68
16
0
16
1.22
71927678--71927730
23
2.4
22
76
20
56
9
18
1
69
1.25
71940790--71940853
33
1.9
33
96
0
119
32
26
4
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1.77
71942694--71942760
24
2.8
24
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15
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26
23
20
28
1.99
71948480--71948854
188
2.0
188
100
0
750
31
16
15
36
1.90
71949857--71949881
7
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7
100
0
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0
0
76
0.80
71950652--71950701
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24
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0
100
38
4
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40
1.69
71953124--71953231
26
4.2
26
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0
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71958095--71958156
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1.66
71959246--71959397
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2.8
54
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5
157
26
24
26
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1.99
71960450--71960477
6
4.7
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100
0
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0
0
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1.00
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22
2.2
22
100
0
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35
27
12
25
1.92
71970061--71970110
24
2.0
25
81
14
59
44
6
0
50
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71970439--71970549
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2.1
53
98
0
213
43
10
24
21
1.84
71970654--71970696
17
2.6
16
82
10
50
44
2
2
51
1.27
71970665--71970694
15
1.9
16
93
6
53
46
0
3
50
1.18
71974275--71974379
51
2.1
51
100
0
210
59
29
7
3
1.43
71974290--71974411
40
3.0
40
80
8
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2
1.41
71974279--71974426
11
13.8
11
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1.49
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1.93
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1.89
71975950--71975996
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2.0
25
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2.2
25
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5
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30
1.37
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1.8
171
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17
5.1
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23
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14
10
19
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71984605--71984656
13
3.7
13
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15
9
17
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1.64
71984591--71984668
30
2.6
30
97
0
147
14
10
19
56
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13
1.9
13
100
0
50
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40
1.51
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20
2.2
20
91
0
70
68
4
6
20
1.31
71989496--71989538
17
2.5
17
82
10
52
76
2
13
6
1.08
71989501--71989538
18
2.2
18
90
4
60
78
2
13
5
1.02
71990168--71990522
45
7.4
50
69
19
197
28
24
16
30
1.97
71990271--71990634
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3.9
94
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10
381
28
23
18
29
1.98
71990271--71990635
193
1.9
184
80
9
414
28
24
18
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71991773--71991842
1
70.0
1
72
0
50
4
7
2
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0.80
71991770--71991840
11
6.2
11
77
19
74
4
8
2
84
0.84
71991773--71991842
24
3.1
21
80
11
77
4
7
2
85
0.80
71991771--71991839
36
2.0
35
78
18
65
4
8
2
84
0.86
71991796--71991842
20
2.3
20
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7
60
6
6
2
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4
16.0
4
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16
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4
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25
1.34
71997059--71997128
9
8.0
8
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64
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1.34
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2.0
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4
145
42
17
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29
1.81
72026112--72026206
42
2.2
42
81
5
102
31
23
17
27
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344