Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  343  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111431395--111431720
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3.2
103
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0
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12
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2
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2.7
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5
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1.45
111439411--111439458
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3.1
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2
2
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8
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1
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2.6
275
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128
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2.5
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2.7
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3
79
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5
3
56
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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111451844--111451895
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6.5
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82
8
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1
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1.9
129
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0
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0
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0
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100
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28
23
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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119
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0
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2.7
107
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329
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12
22
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2.2
193
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18
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28
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1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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36
85
0
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13
25
28
1.93
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27
13
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31
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2.0
26
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70
37
24
15
22
1.92
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30
2.5
33
87
12
137
27
13
26
31
1.94
111614758--111614810
28
2.0
26
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7
70
37
24
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22
1.92
111620510--111620569
28
2.1
28
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5
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18
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19
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12
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29
24
0
46
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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38
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28
28
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0
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1.30
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111744293--111744340
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2.2
22
89
10
73
31
0
2
66
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.95
111780960--111781052
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2.0
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0
92
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14
34
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344