Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  315  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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1.80
103548278--103548366
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2.7
32
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92
32
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12
42
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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18
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1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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10
55
1.60
103655881--103655938
21
2.8
21
80
12
66
15
12
8
63
1.50
103655899--103655937
20
2.0
20
90
10
62
10
12
10
66
1.44
103657929--103657964
2
18.0
2
94
0
63
52
0
0
47
1.00
103662200--103662271
20
3.7
20
71
17
53
37
1
4
56
1.27
103662571--103662615
19
2.5
17
79
13
54
73
6
2
17
1.15
103692801--103692863
24
2.6
24
69
14
58
47
14
14
23
1.80
103696845--103697165
50
6.4
50
93
1
536
36
15
21
26
1.94
103697149--103697350
31
6.5
31
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2
289
28
18
25
27
1.98
103697388--103697513
47
2.7
47
83
4
148
28
15
25
30
1.95
103702532--103702855
162
2.0
163
96
0
605
26
19
20
33
1.97
103705246--103705270
12
2.1
12
100
0
50
24
0
0
76
0.80
103711160--103711204
23
1.9
23
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4
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24
17
0
57
1.40
103716485--103716610
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1.9
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1
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34
1.66
103717463--103717580
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2.1
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3
204
33
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42
1.76
103717463--103717587
55
2.2
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2
189
34
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15
43
1.74
103722085--103722134
26
2.0
24
88
7
73
64
6
0
30
1.18
103722074--103722149
22
3.4
21
74
20
66
71
5
0
23
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103722210--103722242
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2.1
16
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11
50
69
0
0
30
0.88
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31
2.0
31
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54
11
3
30
1.51
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14
2.6
15
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12
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0
0
35
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61
1.9
60
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8
139
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7
0
48
1.37
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0
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0
0
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2
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0
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1
0
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0
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0
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0
0
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3.3
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5
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7
29
1.47
103745107--103745234
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5.5
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3
5
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2.3
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0
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1.65
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2.1
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0
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5
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2.0
17
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0
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0
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10
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9
17
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1.75
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16
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100
0
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6
4.7
6
100
0
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0
0
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50
1.00
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0
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0
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1.52
103754231--103754283
6
8.8
6
82
0
52
0
22
32
45
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103754228--103754270
21
2.0
21
90
0
68
0
18
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48
1.48
103754237--103754288
9
5.8
9
79
0
50
0
23
30
46
1.53
103754228--103754288
24
2.4
27
89
8
92
0
21
31
47
1.51
103759822--103759876
9
6.2
9
91
2
76
43
25
9
21
1.82
103761543--103761700
80
2.0
80
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230
24
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6
34
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2.0
29
100
0
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1.48
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103775708--103775745
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2.2
17
90
0
58
28
0
0
71
0.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344