Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  12  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
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20
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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3.0
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0
0
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35
18
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
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16
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18
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18
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2.0
29
100
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17
20
17
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17
12
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2.5
22
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19
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12
45
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4565424--4565507
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18
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13
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1.61
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3
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14
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24
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1.57
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21
2.0
22
85
4
59
45
0
2
52
1.13
4613991--4614042
17
2.9
18
81
18
56
36
3
0
59
1.16
4614428--4614483
26
2.2
26
86
0
76
50
3
1
44
1.29
4615145--4615206
30
2.1
30
90
0
97
27
3
11
58
1.48
4616890--4616928
19
2.1
19
85
9
53
56
0
2
41
1.13
4617038--4617088
21
2.4
21
83
0
57
64
5
1
27
1.27
4619508--4619544
19
2.0
19
89
5
58
45
0
0
54
1.00
4620355--4620444
44
2.0
44
100
0
180
38
6
21
33
1.79
4621843--4621898
28
2.0
28
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10
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3
35
1.40
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13
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50
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2
0
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1.11
4629270--4629312
17
2.5
17
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11
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48
6
0
44
1.29
4629649--4629682
3
11.3
3
87
0
50
58
0
5
35
1.22
4629947--4629993
21
2.2
22
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11
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31
0
2
65
1.04
4630005--4630041
20
1.9
18
89
10
56
70
2
2
24
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4630055--4630142
5
16.2
5
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15
61
70
0
4
25
1.06
4630085--4630130
6
8.5
6
84
15
57
71
0
0
28
0.86
4630055--4630130
16
4.6
16
70
19
59
71
0
2
26
1.00
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21
2.4
19
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13
67
71
0
0
28
0.86
4630055--4630128
28
2.7
29
76
19
77
70
0
2
27
1.01
4630055--4630142
11
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10
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17
61
70
0
4
25
1.06
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24
2.3
22
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12
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67
0
1
30
1.02
4652039--4652071
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2.1
16
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0
57
39
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24
1.89
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132
5.7
132
97
0
1373
29
25
17
27
1.97
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107
3.7
107
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552
32
19
17
30
1.95
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22
2.3
22
83
13
59
42
8
0
50
1.32
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20
2.1
19
86
9
55
32
5
2
60
1.32
4681757--4681794
19
2.0
20
89
5
60
36
5
2
55
1.37
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3
8.7
3
100
0
52
69
0
0
30
0.89
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28
2.4
28
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2
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5
0
50
1.26
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35
2.0
35
100
0
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1.70
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28
2.2
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32
1.68
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18
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17
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10
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49
1
1
47
1.23
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3
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3
100
0
50
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0
32
0
0.90
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2.0
36
100
0
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28
5
5
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1.42
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25
2.0
25
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0
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63
2
0
34
1.06
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9
17.7
9
70
17
77
62
2
3
32
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4711430--4711492
9
6.6
10
72
20
55
33
0
3
63
1.10
4711408--4711473
17
3.8
17
76
21
57
34
1
0
63
1.04
4711437--4711490
27
2.0
27
89
7
83
35
0
3
61
1.14
4719953--4720000
24
2.0
24
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8
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31
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3.4
21
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16
22
16
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16
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6
0
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20
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0
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26
2.0
26
88
8
75
30
0
6
63
1.19

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344