Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  195  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65061412--65061529
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1.9
59
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4
4
50
1.41
65064227--65064349
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1.87
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0
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0
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28
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3.2
31
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2.1
110
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28
29
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33
1.86
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2.8
141
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0
737
29
28
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1.87
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3.7
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28
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2.0
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1.9
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28
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1.9
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2
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29
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2.9
43
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185
24
15
26
34
1.95
65112743--65112866
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2.5
49
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22
29
20
27
1.99
65112887--65113100
48
4.6
46
73
9
139
23
26
21
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
94
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3
234
23
26
21
29
1.99
65121981--65122195
48
4.6
47
78
4
184
23
25
20
30
1.98
65121887--65122155
94
2.9
94
80
5
242
24
27
19
28
1.99
65121981--65122204
94
2.4
94
80
1
234
24
25
19
30
1.98
65122021--65122203
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46
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25
19
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1.98
65124378--65124412
14
2.6
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4
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28
2
14
54
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40
2.1
40
90
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132
28
24
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0
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0
0
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8
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1.29
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23
21
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1.8
110
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23
23
1.96
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71
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22
1.08
65159822--65159870
20
2.5
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4
12
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1.58
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4
4
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52
3.4
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181
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3
60
1.31
65168110--65168283
78
2.3
76
80
4
206
31
4
3
60
1.31
65168110--65168280
26
6.7
24
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4
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60
1.32
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2.0
27
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5
0
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2.0
43
90
0
138
34
5
11
48
1.63
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40
4.6
40
81
5
183
27
15
23
33
1.95
65178340--65178497
81
2.0
81
87
0
226
27
14
24
33
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.4
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65
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34
0
0.93
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0
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21
18
12
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1.82
65181072--65181109
18
2.1
18
90
0
58
21
23
10
44
1.83
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20
3.5
20
73
7
61
11
25
17
45
1.81
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46
5.8
48
78
8
233
23
29
19
27
1.98
65186007--65186272
47
5.7
47
78
11
221
22
28
19
28
1.98
65186056--65186275
94
2.3
92
82
10
252
22
29
20
28
1.98
65186007--65186272
140
1.9
141
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360
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28
19
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0
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0
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9
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1.71
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2.0
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2.1
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1.98
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27
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25
1.98
65239398--65239643
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2.5
100
86
2
334
28
28
18
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65249317--65249362
13
3.7
13
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51
30
2
0
67
1.03
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15
100
0
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6
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21
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0
0
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0
0
38
0.96
65258157--65258205
26
2.0
26
88
8
75
65
6
0
28
1.16
65258915--65258962
16
3.1
16
82
11
64
60
8
2
29
1.37
65258915--65258955
14
2.7
15
85
11
57
58
9
0
31
1.31
65260640--65260744
19
5.5
19
77
11
108
34
0
0
63
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10
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10
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79
33
0
0
64
1.07
65260631--65260740
38
2.8
39
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6
134
35
0
0
62
1.08
65260641--65260742
9
10.6
9
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20
82
33
0
0
64
1.07
65260786--65260824
20
1.9
20
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51
28
0
5
66
1.12
65260835--65261053
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275
31
10
18
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5
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17
1.84
65268548--65268707
41
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2
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24
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32
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24
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10
4.5
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21
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65277383--65277430
21
2.3
21
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3
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45
22
18
12
1.83
65278411--65278448
20
1.9
20
88
0
58
39
0
5
55
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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0
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2.0
23
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0
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1.61
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23
2.2
23
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0
64
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4
22
1.58
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26
2.0
26
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10
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0
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2.0
16
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0
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12
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2.0
21
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74
0
16
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1.06
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1.9
71
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22
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1.9
95
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22
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2.1
137
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26
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26
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26
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2.3
18
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57
7
0
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1.27
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18
1.9
18
88
0
52
60
2
2
34
1.26
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15
2.5
15
100
0
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3
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3
100
0
52
34
0
0
65
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65343512--65343678
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3.6
47
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28
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1.98
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2.3
94
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258
28
19
28
23
1.98
65343742--65343911
49
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164
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30
1.9
30
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0
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2.3
21
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0
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17
17
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18
2.3
18
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0
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33
11
11
42
1.78

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344