Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  296  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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Period
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Copy
Number
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Score
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1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
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0
26
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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60
1.49
98865799--98865825
13
2.1
13
100
0
54
51
14
0
33
1.43
98869599--98869636
17
2.2
17
100
0
76
31
28
23
15
1.96
98875720--98876218
46
10.8
46
90
0
703
21
24
14
40
1.89
98875720--98876218
185
2.7
185
92
0
804
21
24
14
40
1.89
98884338--98884544
63
3.3
63
77
2
209
28
16
26
28
1.97
98887606--98887657
25
2.1
25
96
0
95
26
19
15
38
1.91
98892762--98892801
19
2.1
19
100
0
80
25
15
10
50
1.74
98896220--98896253
17
2.0
17
88
0
50
50
2
14
32
1.58
98896322--98896465
3
47.0
3
72
8
103
61
4
5
29
1.38
98896554--98896613
7
8.3
7
73
12
50
66
1
0
31
1.01
98897789--98897821
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1.9
17
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63
3
6
27
1.32
98897913--98898132
3
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3
67
15
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2
8
32
1.42
98897868--98897928
22
2.8
22
80
2
61
68
6
6
18
1.33
98898132--98898163
16
2.0
16
93
0
55
50
6
21
21
1.71
98898267--98898304
16
2.4
16
86
8
51
63
0
7
28
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98898403--98898429
3
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3
100
0
54
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0
0
33
0.92
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3
17.3
3
84
7
70
61
0
5
32
1.20
98899398--98899449
24
2.2
24
89
6
79
61
0
5
32
1.20
98899398--98899456
18
3.4
17
86
6
73
59
0
5
35
1.20
98899398--98899456
21
2.8
20
80
19
68
59
0
5
35
1.20
98901030--98901063
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2.1
16
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0
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52
2
2
41
1.31
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1.9
29
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13
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10
0
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1.33
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39
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28
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2
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1.53
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4.0
31
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1
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1.25
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17
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44
1
0
53
1.11
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24
2.3
24
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48
0
1
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1.11
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17
2.1
17
100
0
70
31
17
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17
1.93
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64
2.0
64
83
0
160
34
12
14
38
1.84
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30
3.8
30
90
0
181
24
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3
23
1.66
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25
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100
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98915444--98915523
30
2.7
29
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1.38
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15
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6
69
31
2
2
64
1.16
98915732--98915783
8
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8
82
8
61
30
1
1
65
1.14
98916561--98917355
236
3.4
236
90
3
1235
40
18
9
30
1.83
98917886--98917938
4
12.5
4
82
7
61
50
3
0
45
1.19
98917897--98917946
22
2.3
22
92
0
82
48
4
0
48
1.20
98922753--98922938
59
3.1
58
67
17
146
42
2
3
51
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98922746--98923036
120
2.4
122
88
4
453
43
2
5
49
1.36
98922980--98923016
19
2.0
19
85
15
51
45
0
0
54
1.00
98923181--98923271
45
2.0
45
85
2
121
37
28
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27
1.82
98923252--98923304
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3.2
16
94
5
97
37
37
0
24
1.56
98928705--98928761
30
1.9
30
85
0
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12
26
35
26
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98933553--98933901
174
2.0
174
96
1
637
18
22
22
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1.95
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2.3
33
80
0
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29
10
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2.5
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159
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43
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1.82
98938922--98938966
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2.5
19
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10
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66
17
0
15
1.25
98939025--98939251
60
3.3
70
78
15
271
55
13
0
31
1.39

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344