Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  55  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17856994--17857021
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2.8
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2.0
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0
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22
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0
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2.0
23
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40
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1.76
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22
3.7
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2
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2.0
96
91
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19
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48
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17927335--17927553
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2.3
97
80
2
244
26
16
29
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17929248--17929443
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0
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35
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2.0
18
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11
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2
267
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17
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27
2.1
26
83
9
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30
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28
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1.95
17979390--17979432
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2
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100
0
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20
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27
27
1.99
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2.6
25
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1
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36
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19
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19
92
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228
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10
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18006854--18006988
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2.5
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226
35
15
10
38
1.82
18006861--18006988
36
3.5
36
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2
238
35
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10
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2.0
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10
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2.3
166
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672
26
25
16
30
1.97
18007383--18007819
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83
81
14
446
26
25
17
31
1.97
18007629--18007845
78
2.8
78
87
2
310
26
24
18
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
131
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17
33
1.96
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2.3
78
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290
25
23
18
33
1.97
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25
2.0
25
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62
27
14
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24
15
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1.93
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4.0
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455
22
24
16
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239
23
25
17
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1.96
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2.1
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19
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248
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11
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18057305--18057412
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89
0
171
32
6
25
36
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18058894--18058943
26
1.9
26
84
8
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40
22
14
24
1.90
18061279--18061364
19
4.2
19
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100
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10
17
33
1.84
18061280--18061364
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1.9
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16
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9
15
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0
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8
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1.56
18077802--18077835
6
5.5
6
96
3
59
85
0
0
14
0.60
18077854--18077921
9
7.6
9
80
6
66
30
7
17
44
1.76
18081157--18081214
30
1.9
30
92
0
98
25
31
25
17
1.97
18082288--18082323
18
1.9
18
88
5
54
16
2
8
72
1.21
18086278--18086570
143
2.0
143
100
0
586
35
9
19
36
1.84
18088334--18088394
3
22.3
3
77
15
53
21
0
1
77
0.86
18088352--18088398
11
4.1
12
89
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71
14
0
4
80
0.85
18088333--18088398
34
1.9
35
84
9
91
19
0
3
77
0.90
18088333--18088394
12
5.5
11
83
14
72
20
0
1
77
0.85
18102301--18102374
8
9.2
8
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16
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1
0
35
63
1.03
18102304--18102409
11
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11
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115
0
2
34
61
1.17
18102312--18102408
33
3.0
33
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1
151
1
3
34
61
1.18
18102243--18102409
11
15.5
11
74
10
94
3
4
32
59
1.34
18103123--18103164
11
3.8
11
87
0
57
0
7
35
57
1.26
18103123--18103164
22
1.9
22
90
0
66
0
7
35
57
1.26
18105228--18105261
3
11.3
3
100
0
68
32
0
0
67
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18110927--18110987
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3.7
16
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8
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27
24
1
45
1.62
18110942--18110996
18
3.2
18
69
10
60
23
20
3
52
1.62
18110927--18110996
34
2.1
34
100
0
140
25
22
2
48
1.64
18115050--18115194
49
2.9
50
80
3
175
28
24
20
26
1.99
18116002--18116062
30
2.0
30
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0
77
31
22
6
39
1.80
18119815--18119844
14
2.1
14
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0
51
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3
0
60
1.14
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1.9
20
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0
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42
0
15
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1.47
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21
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20
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54
0
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1.31
18127290--18127345
25
2.3
24
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1
0
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1.08
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2.4
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56
3
0
39
1.16
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125
1.9
127
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39
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1.86
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2.4
21
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65
0
5
28
1.16
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2.0
31
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0
8
29
1.24
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24
3.1
23
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15
76
59
0
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27
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3
100.0
3
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19
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4
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26
1.42
18128668--18128721
17
2.8
20
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68
0
7
24
1.15
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2.1
26
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50
0
0
49
1.00
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8
100
0
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11
0
0
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0.50
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14
2.1
14
100
0
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16
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26
50
1.70
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19
2.0
20
89
5
60
71
10
0
18
1.14
18134825--18134885
24
2.5
24
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7
61
34
0
4
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1.18
18137573--18137900
3
109.7
3
66
12
77
28
8
3
60
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18137709--18137760
14
3.6
14
82
5
59
36
3
1
57
1.28
18137924--18137962
17
2.3
17
90
0
60
25
7
0
66
1.18
18137955--18137989
17
2.1
17
88
0
52
25
0
8
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1.21
18137968--18138025
26
2.3
26
77
19
68
31
5
5
58
1.42
18138142--18138201
13
4.4
14
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16
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18
10
3
68
1.32
18140714--18140773
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2.4
25
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0
111
36
0
20
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1.52
18141425--18141600
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3.8
46
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4
201
21
21
28
28
1.98
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1.8
93
91
0
281
21
21
29
27
1.99
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15
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2
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10
18
12
60
1.59
18146958--18147133
46
3.8
46
79
4
210
21
21
28
28
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344