Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  61  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19650875--19650950
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2.2
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0
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0
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0
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80
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0
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61
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19695561--19695686
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39
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22
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1.9
175
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0
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0
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52
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5
46
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52
0
0
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2
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44
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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0
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120
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0
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24
0
3
71
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19785451--19785489
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0
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174
26
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28
30
1.96
19810172--19810326
81
1.9
81
86
2
222
26
15
28
29
1.96
19810168--19810347
81
2.2
81
81
2
218
26
15
27
30
1.96
19818225--19818402
27
6.6
27
81
3
187
26
15
28
29
1.96
19818226--19818381
82
1.9
81
86
3
224
26
16
28
28
1.96
19818222--19818402
82
2.2
81
82
2
220
26
16
28
29
1.96
19819842--19819884
21
2.0
21
95
0
77
0
53
20
25
1.46
19823456--19823507
19
2.7
20
84
6
79
32
0
38
28
1.57
19825442--19825466
10
2.5
10
100
0
50
0
16
36
48
1.46
19825401--19825506
50
2.1
51
89
1
160
16
17
23
41
1.90
19825459--19825588
41
3.2
41
90
1
190
23
18
20
37
1.94
19835760--19836496
367
2.0
367
100
0
1474
32
9
19
38
1.84
19838482--19838511
12
2.5
12
94
0
51
60
3
0
36
1.14
19839830--19839884
21
2.5
22
82
8
60
29
18
29
23
1.98
19849223--19849260
19
2.0
19
90
10
60
21
7
0
71
1.11
19857274--19857329
26
2.1
27
87
6
80
41
25
19
14
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19862640--19862741
52
2.0
52
92
0
168
22
24
10
42
1.85
19863862--19863911
25
2.0
25
100
0
100
28
36
8
28
1.85
19886249--19886276
10
2.8
10
100
0
56
53
28
0
17
1.44
19898608--19898634
6
4.5
6
100
0
54
18
33
33
14
1.92
19901355--19901534
96
1.9
96
88
3
272
29
18
13
38
1.89
19901355--19901564
96
2.2
96
84
2
269
30
18
12
38
1.88
19901452--19901931
135
3.6
135
81
4
526
30
18
12
37
1.88
19901449--19901968
133
3.9
133
80
4
431
30
19
12
37
1.89
19918525--19918684
21
7.6
21
79
3
135
44
15
21
18
1.86
19918528--19918684
42
3.7
42
80
0
170
44
14
21
19
1.86
19918514--19918684
63
2.7
63
81
5
215
44
15
22
18
1.86
19922761--19922811
26
2.0
26
84
0
66
35
25
21
17
1.95
19930956--19930990
4
8.8
4
93
0
52
45
22
5
25
1.74
19930960--19931019
16
3.8
16
75
0
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40
18
10
31
1.84
19930996--19931061
28
2.3
29
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5
80
36
15
13
34
1.87
19930984--19931042
16
3.4
16
74
17
55
38
13
11
35
1.82
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8
7.0
8
81
8
67
25
5
24
44
1.75
19930965--19931046
36
2.3
36
89
0
128
39
17
10
32
1.84
19931055--19931097
4
10.8
4
94
0
68
25
4
23
46
1.71
19934909--19934944
18
2.0
18
89
10
56
75
2
0
22
0.94
19935730--19935813
17
4.9
16
77
7
69
16
17
32
33
1.93
19938859--19939027
45
3.8
45
84
0
212
25
19
15
39
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19938856--19939027
90
1.9
90
86
0
245
25
19
16
38
1.92
19939009--19939123
45
2.5
46
79
6
128
20
19
15
44
1.87
19941576--19941615
18
2.2
18
86
0
53
15
32
5
47
1.66
19946190--19946223
15
2.2
15
89
5
50
0
14
0
85
0.60
19961345--19961442
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2.3
43
80
5
110
15
30
33
20
1.93
19969412--19969508
48
2.0
48
100
0
194
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28
1.76
19976980--19977004
12
2.1
12
100
0
50
16
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1.58
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293
27
18
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23
1.97
19977831--19978108
50
5.6
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80
5
295
29
17
30
23
1.97
19977689--19978111
149
2.9
141
83
7
480
27
18
30
23
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344