Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   

This is table  51  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16923236--16923270
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2
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0
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5
5
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19
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1.30
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110
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3
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1.40
16923581--16923632
24
2.2
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2.0
32
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2.0
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4
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2.0
112
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22
26
2.00
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45
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124
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18
26
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1.97
16952497--16952674
90
2.0
90
82
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221
22
18
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32
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4.5
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80
9
202
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19
27
23
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3.4
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24
1.99
16957673--16957843
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3.7
46
81
9
204
28
19
28
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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11
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17
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5
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0
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16
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16
2.4
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0
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2
42
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211
2.0
210
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10
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2
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100
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26
40
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2.0
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14.4
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2
18
33
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17010701--17011271
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42.8
13
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225
44
2
18
33
1.65
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2.6
36
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0
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30
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18
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1.9
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85
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99
40
0
17
42
1.49
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18
2.4
18
88
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69
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13
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1.35
17036812--17036923
27
4.2
26
80
7
125
39
23
22
15
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
54
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15
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2.0
16
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0
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15
0
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56
1.40
17039513--17039545
15
2.1
16
88
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50
18
0
27
54
1.44
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2.4
44
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144
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23
13
33
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18
2.9
18
83
10
72
54
0
20
24
1.44
17051223--17051269
19
2.5
18
89
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67
57
0
19
23
1.41
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2.2
24
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0
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44
15
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1.84
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48
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19
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1.94
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2.0
96
93
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22
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1.94
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27
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2.0
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2.9
365
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328
29
16
21
32
1.95
17104959--17105270
144
2.2
143
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16
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1.95
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88
88
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27
19
19
34
1.95
17105743--17105927
72
2.5
72
81
1
217
29
15
24
30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17107695--17107722
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9.3
3
100
0
56
35
0
0
64
0.94
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35
2.8
31
78
15
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33
7
5
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1.52
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2.1
25
92
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32
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43
18
1.74
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4.4
30
87
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176
13
31
33
21
1.92
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59
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43
22
8
26
1.81
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82
74
6
3
15
1.16
17123642--17123720
34
2.3
34
80
8
90
74
7
3
13
1.17
17125070--17125096
3
9.0
3
100
0
54
66
0
0
33
0.92
17125354--17125396
16
2.6
16
82
10
52
46
2
48
2
1.27
17125392--17125433
20
2.2
19
86
4
57
61
0
35
2
1.09
17135070--17135119
22
2.3
22
93
3
84
52
14
16
18
1.76
17135446--17135477
13
2.5
13
100
0
64
25
21
0
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1.46
17135493--17135524
15
2.3
15
89
10
50
40
18
0
40
1.51
17135986--17136050
21
3.1
20
80
8
76
38
24
18
18
1.93
17136370--17136538
79
2.3
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14
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1
40
1.59
17136428--17136472
20
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19
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17
0
51
1.46
17137830--17137869
5
8.0
5
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55
0
0
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55
0
0
44
0.99
17140947--17141010
24
2.7
24
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4
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20
14
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34
1.92
17159320--17159490
43
4.0
42
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17
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24
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1.94
17159323--17159495
85
2.0
85
80
10
194
24
14
24
36
1.93
17160348--17160454
54
2.0
54
96
0
196
17
24
34
23
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
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0
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4
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40
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3.7
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26
17
24
32
1.96
17166909--17167021
43
2.6
43
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5
140
26
17
23
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1.97
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112
2.0
112
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0
403
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13
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28
4
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58
1.47
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11
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0
0
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29
1.97
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2
0
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1.08
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0
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1.30
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2.4
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100
0
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1.70
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2.0
42
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0
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26
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13
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0
8
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1.32
17212695--17212724
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7
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40
0
10
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0
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2.1
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1.79
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17
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54
0
0
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2.7
27
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2
0
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1.15
17213456--17213490
18
2.0
17
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52
54
0
0
45
0.99
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1.9
149
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1
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3
2
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1.33
17213476--17213654
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128
49
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2
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17213576--17213610
18
2.0
17
88
5
52
60
0
0
40
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17213686--17213717
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0
0
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1.00
17213439--17213731
120
2.4
120
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2
482
50
5
2
42
1.36
17215486--17215532
19
2.4
19
96
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85
44
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17215540--17215632
41
2.2
41
98
1
177
39
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2
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2.4
14
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4
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65
0
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8
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0
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3.2
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28
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59
0
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38
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17217064--17217108
20
2.2
20
84
7
56
60
0
2
37
1.09

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344