Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  64  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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G
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44
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0
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1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
Percent
Indels
Score
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2.2
14
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0
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12
35
16
35
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
20919707--20919783
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0
82
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1.99
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20
3.3
20
91
4
100
32
20
11
34
1.90
20921626--20921681
11
5.5
11
71
16
57
32
21
12
33
1.91
20927963--20928033
24
3.0
24
89
2
108
30
22
19
26
1.98
20928079--20928149
20
3.6
19
90
7
108
35
19
11
33
1.88
20928083--20928138
11
5.5
11
71
16
57
33
19
12
33
1.89
20930673--20930698
10
2.6
10
100
0
52
0
7
0
92
0.39
20934903--20935020
18
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18
87
6
150
38
14
11
36
1.81
20934903--20935020
35
3.3
35
90
3
173
38
14
11
36
1.81
20936751--20936782
16
2.0
16
100
0
64
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31
0
31
1.58
20941321--20941356
17
2.2
17
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5
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38
11
0
50
1.38
20946335--20946371
18
2.1
18
90
5
58
45
2
13
37
1.58
20947437--20947565
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5
190
35
15
22
26
1.94
20947541--20947720
31
5.8
31
90
2
281
28
20
26
24
1.99
20947740--20947902
47
3.6
46
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5
147
29
15
26
28
1.96
20947832--20947946
42
2.7
42
87
4
160
30
14
27
26
1.95
20949000--20949099
20
5.2
20
90
7
161
12
40
24
24
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20950254--20950432
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2.2
83
89
0
277
22
25
18
33
1.97
20959533--20959591
29
2.0
30
86
3
84
49
15
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28
1.70
20965650--20965723
30
2.5
29
86
6
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18
5
0
75
0.99
20965651--20965723
5
13.8
5
78
9
58
19
4
0
76
0.94
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2.5
42
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0
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10
23
1.89
20972155--20972231
22
3.5
22
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8
77
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10
16
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1.83
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2.2
12
100
0
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23
0
7
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1.14
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0
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1.21
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4.2
26
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0
184
33
5
24
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1.79
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2.5
20
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9
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20
4
2
74
1.08
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18
2.5
19
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13
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33
0
0
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0.92
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19
2.2
20
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4
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2
28
0
69
1.01
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3.5
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0
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33
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21
27
1.96
20991381--20991560
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1.9
94
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0
252
30
17
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31
1.96
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2.3
93
82
4
248
30
17
20
31
1.96
20991611--20992113
45
11.3
43
73
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254
35
15
17
31
1.91
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5.7
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6
315
35
16
17
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1.92
20991616--20992106
134
3.7
134
80
4
526
35
15
17
30
1.92
20996998--20997081
26
3.2
26
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0
141
35
25
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1.80
21018729--21018811
41
2.0
41
95
0
148
45
14
12
27
1.80
21020352--21020378
9
3.0
9
100
0
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0
55
1.35
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13
2.2
14
94
5
53
76
0
3
20
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21022836--21022897
29
2.1
30
82
11
74
46
14
11
27
1.78
21022851--21022907
29
1.9
30
85
3
80
47
15
8
28
1.75
21023950--21024057
29
3.8
29
71
11
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25
6
3
64
1.34
21024027--21024074
15
3.1
15
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6
60
22
8
0
68
1.16
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2.0
44
100
0
180
23
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8
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10.6
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13
162
34
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21
22
1.97
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88
27.7
88
85
2
2989
33
20
23
22
1.97
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33
22
22
21
1.97
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3.3
44
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116
33
22
22
22
1.98
21032096--21032504
44
9.3
44
64
14
144
33
21
24
21
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344