Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   

This is table  32  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11010616--11010730
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1.94
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2.5
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11032421--11032513
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0
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2.6
47
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24
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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15
11
37
1.83
11142274--11142377
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2.9
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94
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174
36
15
11
36
1.84
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43
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20
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1.9
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20
22
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2.1
18
89
10
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11
5
5
77
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11183207--11183298
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0
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11183524--11183568
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5
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7
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42
22
0
35
1.54
11183516--11183570
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1.99
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1.8
97
86
1
259
12
31
14
41
1.84
11201216--11201354
27
4.9
29
85
10
164
23
28
21
26
1.99
11201236--11201365
27
4.8
27
89
3
172
23
29
21
26
1.99
11201216--11201390
54
3.1
54
81
4
152
22
28
20
28
1.98
11201236--11201390
81
1.9
81
82
0
193
22
27
21
28
1.99
11209849--11210006
82
1.9
82
94
2
282
38
15
16
29
1.90
11220249--11220310
32
1.9
32
90
6
99
20
12
3
62
1.43
11227980--11228058
39
2.0
39
95
0
140
31
12
12
43
1.80
11239446--11239512
17
3.8
18
76
20
70
11
2
10
74
1.17
11240025--11240056
14
2.3
14
94
0
55
3
18
46
31
1.65
11245148--11245179
14
2.3
14
94
0
55
3
18
46
31
1.65
11255024--11255130
8
13.7
7
72
21
56
75
1
19
2
1.02
11255064--11255130
4
17.8
4
73
22
56
74
0
23
1
0.90
11255031--11255074
22
2.0
23
86
4
63
75
4
15
4
1.14
11255075--11255129
6
9.2
6
76
7
58
76
0
21
1
0.88
11255016--11255125
37
2.9
38
79
18
113
76
1
17
4
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11255039--11255107
17
3.7
17
75
14
57
75
2
18
2
1.06
11255065--11255127
12
5.1
12
82
9
74
74
0
23
1
0.90
11255065--11255129
23
2.6
25
78
11
89
75
0
23
1
0.89
11255064--11255130
29
2.4
30
76
20
81
74
0
23
1
0.90
11256036--11256139
41
2.6
41
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1
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27
19
21
31
1.97
11274953--11275023
31
2.4
31
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4
110
26
14
19
39
1.90
11274953--11275021
29
2.3
29
90
5
102
27
14
18
39
1.90
11276989--11277876
296
3.0
296
98
0
1719
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7
17
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1.77
11278794--11278841
21
2.3
21
88
0
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25
16
1.89
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2.1
103
78
7
221
35
16
11
36
1.84
11288192--11288253
27
2.3
27
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0
106
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17
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1.92
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14
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13
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10
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7
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17
1.54
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22
2.2
22
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13
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48
14
0
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1.44
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26
2.0
24
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30
0
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1.19
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1.9
30
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0
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24
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1.90
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13
2.7
13
100
0
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14
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2.0
36
97
0
137
30
17
15
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1.91
11317771--11317854
26
3.2
26
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152
36
3
22
36
1.72
11326149--11326198
21
2.4
21
75
0
55
28
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20
46
1.74
11329571--11329636
21
3.1
22
69
8
64
37
22
18
21
1.94
11330466--11330505
7
5.4
7
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11
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60
0
0
40
0.97
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19
2.4
19
76
20
51
36
23
4
36
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11331343--11331440
45
2.2
43
84
10
133
56
11
3
29
1.50
11336226--11336273
21
2.3
22
79
17
57
18
10
20
50
1.76
11336767--11336815
25
2.0
25
95
0
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40
14
8
36
1.75
11351420--11351496
29
2.6
29
75
2
82
57
2
0
40
1.13
11364149--11364279
54
2.4
54
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5
140
35
13
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11364095--11364263
18
9.4
18
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7
146
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14
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37
1.83
11364147--11364279
36
3.7
36
81
6
135
35
13
12
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45
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5
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0
0
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0.94
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16
2.6
16
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3
66
64
0
0
35
0.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344