Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
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This is table  218  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72229750--72229777
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0
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33
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72237985--72238191
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3.8
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14
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1.95
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26
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2.5
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2.2
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2.2
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100
0
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10
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2.2
20
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4
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23
5.6
23
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2
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24
18
18
38
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5.7
10
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0
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1.19
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2.0
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21
1.97
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25
4.4
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86
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121
28
21
22
28
1.99
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2.1
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0
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2.0
33
100
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24
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3.4
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21
28
1.99
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79
2.2
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211
24
21
28
25
1.99
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80
8
200
25
21
27
25
1.99
72376637--72376814
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2.2
80
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198
24
21
28
24
1.99
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2.6
43
81
5
140
24
19
27
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
1.99
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19
26
1.99
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30
18
27
1.98
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1.9
94
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0
273
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19
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1.98
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4.2
26
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1.76
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2.0
14
100
0
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2.0
18
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27
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28
1.96
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1.96
72416330--72416507
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218
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15
28
29
1.96
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1.9
81
86
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224
26
15
28
28
1.96
72416327--72416507
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2.2
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82
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220
27
15
28
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1.96
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3.2
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63
26
81
29
14
17
38
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72445998--72446265
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20
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40
93
0
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21
27
19
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1.98
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0
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2.0
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95
1
227
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0
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24
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1.97
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22
2.4
21
81
15
52
56
1
5
35
1.35
72470708--72470791
17
4.9
17
74
0
69
25
10
19
45
1.82
72470710--72470817
51
2.1
51
85
0
144
28
10
17
43
1.82
72479063--72479285
40
5.6
40
84
3
227
26
27
21
25
1.99
72479217--72479294
40
1.9
41
82
10
97
26
28
21
23
1.99
72482932--72483193
39
6.7
40
87
7
319
24
27
22
25
2.00
72490859--72491068
39
5.3
39
93
2
325
24
27
22
25
2.00
72490859--72491117
78
3.3
80
85
11
324
24
27
22
25
1.99
72496571--72496671
28
3.6
28
81
10
134
25
27
16
29
1.97
72496573--72496687
56
2.1
55
91
1
185
26
26
17
29
1.97
72503913--72504036
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28
28
15
28
1.96
72505460--72505497
19
2.1
18
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5
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55
2
0
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1.14
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0
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0.91
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2.2
21
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7
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0
31
2
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1.04
72524405--72524449
18
2.5
17
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0
48
1.51
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12
2.1
12
100
0
50
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16
8
8
1.38
72534313--72534337
12
2.1
12
100
0
50
68
16
8
8
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72535743--72535767
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2.1
12
100
0
50
68
16
8
8
1.38
72543612--72543645
14
2.3
15
90
5
52
35
0
47
17
1.48
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6
4.3
6
100
0
52
15
19
30
34
1.93
72547529--72547559
16
1.9
16
100
0
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35
45
0
19
1.51
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6
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75
3
12
9
1.16
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2
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2
100
0
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0
0
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1.00
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0
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20
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21
21
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28
1.98
72565979--72566150
93
1.8
93
94
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21
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27
1.99
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2.6
23
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0
111
21
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31
13
1.92
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2.0
43
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0
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15
1.9
16
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76
0
23
0
0.78
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2.6
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17
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79
2
18
0
0.85
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16
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16
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46
0
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2.4
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5
1
41
1.37
72591499--72591552
21
2.6
21
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5
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1.36
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2.1
18
100
0
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35
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23
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2.0
20
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0
168
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72594604--72594708
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102
52
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1.58
72594601--72594740
59
2.3
62
81
8
171
52
17
2
27
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72596586--72596630
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2.1
21
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0
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53
0
2
44
1.13
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26
83
6
158
26
15
28
29
1.96
72598811--72598966
82
1.9
81
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217
26
15
28
28
1.96
72598807--72598987
82
2.2
81
81
4
213
27
15
28
29
1.96
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0
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0
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0
0
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2.0
21
81
9
50
21
40
14
23
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344