Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  45  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14998217--14998284
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33
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0
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0
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2.0
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2.2
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86
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64
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15046228--15046277
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13
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1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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2.0
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2.2
25
78
12
62
25
21
23
30
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.7
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3
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2.1
28
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1
18
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73
1.14
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1.9
17
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6
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2.0
20
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41
0
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1.9
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66
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19
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1.92
15170456--15170540
40
2.1
40
82
0
98
40
21
18
20
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15172455--15172491
17
2.2
17
95
0
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54
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5
27
1.61
15172713--15173138
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48
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407
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19
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1.98
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101
100
0
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4
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22
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24
1.99
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18
2.2
20
87
12
61
14
4
19
60
1.51
15182372--15182556
79
2.3
81
82
7
218
24
23
27
24
2.00
15182373--15182556
40
4.6
39
80
9
194
25
23
27
23
2.00
15182425--15182579
79
2.0
79
83
7
199
26
21
27
24
2.00
15183953--15184114
43
3.8
42
78
9
175
25
16
25
32
1.96
15184862--15184890
12
2.5
12
94
5
51
37
0
17
44
1.49
15187371--15187450
29
2.7
30
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5
117
43
12
25
18
1.85
15187435--15187570
30
4.5
30
87
0
173
37
11
23
27
1.89
15187291--15187510
120
1.8
120
82
0
278
40
13
25
21
1.90
15199955--15199995
22
1.9
22
90
5
66
65
0
7
26
1.18
15200780--15200817
19
2.0
20
89
5
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52
15
0
31
1.43
15201920--15201962
17
2.5
17
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0
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9
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27
20
1.83
15207931--15208094
44
3.8
44
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6
226
24
21
29
24
1.99
15226925--15227136
105
2.0
105
97
0
397
31
8
16
42
1.80
15227744--15227951
54
3.9
54
83
1
240
25
14
26
33
1.94
15227912--15228011
47
2.1
47
94
0
173
30
14
22
34
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15227923--15228060
47
2.9
47
84
3
143
27
14
26
31
1.95
15230323--15230451
46
2.8
46
91
0
213
31
27
20
20
1.98
15230328--15230470
46
3.1
44
74
13
119
30
27
20
21
1.98
15237721--15237896
46
3.8
46
75
14
173
30
26
20
22
1.98
15246117--15246242
47
2.6
48
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2
191
28
21
28
21
1.99
15251958--15252128
48
3.6
48
80
3
209
28
19
26
25
1.99
15251942--15252128
96
1.9
96
90
0
293
27
19
27
26
1.99
15253794--15253900
42
2.5
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1
144
23
18
27
30
1.98
15260207--15260291
6
13.8
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76
14
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45
10
20
23
1.81
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18
2.2
18
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0
53
55
15
17
12
1.70
15260224--15260288
25
2.6
25
90
0
103
43
10
21
24
1.84
15260217--15260291
25
2.7
29
78
20
95
44
10
20
25
1.83
15260409--15260509
27
3.8
26
85
6
130
38
20
20
19
1.93
15261080--15261382
27
11.2
27
82
3
360
27
18
17
36
1.93
15261080--15261375
54
5.5
54
89
1
434
26
18
17
36
1.94
15261405--15261497
27
3.4
27
76
5
98
27
6
22
43
1.78
15261421--15261525
27
3.9
27
79
2
86
27
8
22
40
1.83
15263203--15263253
26
2.0
26
84
0
66
45
5
11
37
1.65
15264153--15264259
42
2.5
42
81
1
124
23
20
27
28
1.99
15264153--15264267
43
2.7
42
80
1
131
22
20
27
29
1.98
15266161--15266220
30
2.0
30
83
6
77
38
6
26
28
1.81
15266867--15267112
49
4.9
50
81
4
291
26
17
26
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15269857--15269895
15
2.5
15
91
4
60
15
12
15
56
1.68
15271944--15272003
30
2.0
30
83
6
77
38
6
26
28
1.81
15272657--15272880
49
4.5
50
83
3
283
26
16
26
30
1.97
15272654--15272893
100
2.4
98
84
2
302
26
17
26
30
1.97
15284573--15285005
219
1.9
221
90
4
681
32
29
15
23
1.95
15285663--15285821
71
2.2
71
96
1
291
20
30
15
33
1.94
15290829--15290930
29
3.6
29
72
7
84
30
11
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1.72
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2.5
19
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60
29
12
36
21
1.91
15295304--15295406
28
3.6
30
78
10
108
30
14
29
26
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344