Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  269  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
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1.84
89785656--89785763
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1.9
22
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2
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1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
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100
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1.9
19
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144
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48
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382
28
29
16
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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2.5
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1.94
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1.71
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22
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1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.99
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20
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1.99
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47
2.5
46
80
11
120
26
20
31
21
1.98
90032399--90032432
16
2.1
16
88
5
50
8
0
14
76
1.01
90034957--90035082
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2.0
63
98
0
243
39
16
15
27
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90048280--90048330
11
4.7
10
86
13
66
27
33
0
39
1.57
90048323--90048362
21
1.9
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10
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25
22
7
45
1.78
90049505--90049572
7
9.7
7
96
0
127
29
0
14
55
1.40
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2.4
18
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0
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27
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1.80
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55
5.1
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4
55
1.42
90050700--90050880
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3.2
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3
4
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525
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4
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1.42
90052359--90052417
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2.0
30
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1.89
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2.00
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43
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21
16
30
31
1.95
90060353--90060786
126
3.5
126
89
2
615
27
18
15
38
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
2.0
15
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0
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13
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30
1.87
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44
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17
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1.96
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228
2.1
227
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650
28
21
18
31
1.97
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44
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44
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5
124
28
21
18
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1.97
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30
1.66
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12
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0
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25
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1.99
90115540--90115765
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25
21
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25
26
21
27
1.99
90123336--90123561
80
2.8
80
82
10
275
25
26
21
27
1.99
90123336--90123561
120
1.9
120
80
10
266
25
26
21
27
1.99
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39
2.0
39
100
0
156
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28
20
25
1.99
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2.1
14
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0
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0
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28
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27
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1.95
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2.3
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1.23
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58
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62
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7
198
40
1
2
55
1.21
90158394--90158493
50
2.0
50
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1
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47
13
16
24
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210
2.0
210
97
0
797
40
13
16
28
1.87
90171612--90171746
43
3.1
43
80
10
134
33
25
17
23
1.96
90176924--90176983
25
2.4
25
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0
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26
25
21
26
2.00
90177033--90177080
25
2.0
25
88
8
73
35
20
12
31
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90176981--90177195
76
2.9
75
80
8
258
39
24
10
25
1.87
90177128--90177228
48
2.0
51
88
5
154
38
24
9
26
1.87
90182435--90182473
6
6.5
6
90
0
51
48
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20
1.80
90182968--90183016
3
17.0
3
76
16
50
34
0
2
63
1.06
90186257--90186379
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2.7
46
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0
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1.99
90189091--90189150
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4.0
15
77
0
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11
11
15
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90189092--90189151
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2.0
30
90
0
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11
13
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2.4
46
93
0
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22
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27
1.99
90195722--90196032
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8.0
39
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0
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23
27
25
22
2.00
90196077--90196165
43
2.1
43
100
0
178
35
19
8
35
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344