Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   

This is table  258  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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38
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
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132
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21
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31
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29
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.05
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3.2
20
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15
69
71
1
3
23
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1
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1.04
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3.5
26
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12
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72
1
4
22
1.08
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35
2.0
35
82
5
86
72
1
4
21
1.10
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18
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1.98
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144
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17
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1.98
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25
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28
1.98
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2.1
53
98
0
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33
1.95
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10
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10
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0
2
68
1.01
86042091--86042139
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2.4
20
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30
0
2
67
1.02
86042390--86042450
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57
6
0
36
1.25
86042390--86042450
25
2.4
25
86
7
88
57
6
0
36
1.25
86042392--86042445
19
2.9
18
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7
0
33
1.25
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48
1.00
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50
2
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47
1.16
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0
0
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17
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0
0
47
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
T
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(0-2)
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0
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0
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18
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1.83
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2.2
12
100
0
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14
14
44
25
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86185335--86185395
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18
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0
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0
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2.0
16
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12
0
36
1.39

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344