Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  324  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
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16
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11
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7
40
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
24
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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32
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16
24
1.96
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5.5
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12
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16
24
1.96
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2.1
32
100
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132
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3
12
42
1.57
106098095--106098168
31
2.5
31
82
4
80
47
1
21
29
1.59
106098263--106098303
14
2.9
14
85
0
55
29
12
4
53
1.58
106098742--106098798
28
2.1
27
83
3
69
33
0
3
63
1.12
106100246--106100279
17
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16
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47
0
0
52
1.00
106118068--106118119
6
8.7
6
100
0
104
34
0
15
50
1.45
106123784--106123821
18
2.1
18
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0
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18
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23
10
1.79
106124444--106124566
30
4.1
30
93
2
194
26
21
6
45
1.76
106124447--106124560
15
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15
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13
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26
20
7
46
1.76
106129133--106129226
30
3.1
30
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1
161
26
25
6
41
1.79
106129143--106129220
15
5.2
15
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11
70
26
23
7
42
1.81
106129829--106129863
6
5.8
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0
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34
0
14
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1.42
106135453--106135515
21
3.1
19
77
9
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53
11
3
31
1.52
106135460--106135493
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2.3
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0
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52
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0
35
1.38
106136240--106136306
17
3.9
17
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18
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55
4
5
34
1.45
106136466--106136710
134
1.8
131
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309
57
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5
31
1.45
106136691--106136827
3
45.7
3
77
8
102
59
2
8
29
1.40
106136812--106136863
18
2.9
18
72
11
52
59
5
5
28
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
106137936--106138222
137
2.1
137
94
0
502
33
24
17
25
1.96
106138470--106138522
26
2.0
27
85
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74
24
15
22
37
1.92
106140008--106140167
26
6.2
26
84
2
214
36
22
6
34
1.81
106140008--106140167
52
3.1
52
90
0
248
36
22
6
34
1.81
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20
2.0
20
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0
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12
0
28
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1.34
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17
2.8
17
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12
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2
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1.36
106151534--106151673
18
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18
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12
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22
7
1.76
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20
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1.77
106151535--106151667
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2.0
66
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171
24
46
21
7
1.77
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18
10.2
18
70
10
92
25
44
21
9
1.82
106151594--106151806
74
2.9
75
85
2
268
25
44
20
9
1.81
106152677--106152708
15
2.1
15
94
0
55
12
9
0
78
0.97
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24
1.9
24
82
8
58
65
23
6
4
1.35
106154006--106154053
24
2.0
24
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0
60
70
4
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14
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18
2.2
18
90
9
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23
5
0
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1.05
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25
2.3
25
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69
0
10
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15
2.5
15
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16
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71
0
5
23
1.07
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19
2.5
17
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17
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72
0
6
20
1.08
106158517--106158552
3
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3
88
11
54
63
0
5
30
1.17
106158511--106158569
23
2.5
23
74
20
59
61
1
3
33
1.23
106158516--106158569
20
2.5
21
77
19
58
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1
3
33
1.25
106158724--106158845
3
40.0
3
71
14
63
62
4
6
27
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
106162212--106162326
3
38.7
3
80
5
135
59
0
6
33
1.24
106162110--106162243
71
1.9
71
84
7
182
62
2
5
29
1.31
106166834--106166882
25
1.9
26
83
4
64
18
2
20
59
1.48
106172500--106172643
60
2.4
59
77
7
155
30
17
10
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0
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0
0
0.53
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1.8
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93
0
297
26
28
22
22
1.99
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3.8
46
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13
205
28
28
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22
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2
0
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0
115
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10
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146
2.0
146
99
0
583
30
19
14
35
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
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          337   338   339   340   341   342   343   344