Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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This is table  335  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
108694757--108694815
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10
1
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108698780--108698918
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25
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2
0
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108701763--108701834
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2.7
28
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20
5
0
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1.03
108701761--108701834
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5
0
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2.0
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2.0
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108746674--108746720
21
2.2
22
92
3
78
21
38
19
21
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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2
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2
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2.0
256
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0
0
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23
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0
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2.0
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40
3
0
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11
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36
3
0
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1.16
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2.0
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2
0
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63
59
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1.29
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0
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18
2.0
18
100
0
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33
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2.0
15
100
0
60
40
6
0
53
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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3.2
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2
4
26
1.25
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1.9
18
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52
26
5
0
67
1.13
108817161--108817194
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4.0
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85
14
50
73
0
0
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0
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11
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2.0
19
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14
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
108913189--108913264
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40
14
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1.89
108916340--108916377
3
12.7
3
94
0
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63
0
2
34
1.09
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2.0
21
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50
31
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2.0
23
82
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56
15
17
13
53
1.73
108935703--108936326
316
2.0
315
95
0
1124
39
18
11
29
1.86
108940843--108940954
60
1.9
58
87
7
163
37
13
7
41
1.72
108941230--108941274
19
2.4
19
84
0
54
37
8
2
51
1.46
108941431--108941495
23
2.9
22
81
4
76
38
29
3
29
1.72
108960223--108960309
43
2.0
43
100
0
174
37
20
4
36
1.74
108963898--108963950
22
2.4
22
93
6
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30
18
5
45
1.73
108970892--108970970
30
2.6
30
78
13
81
39
0
20
40
1.52
108980795--108980852
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2.0
29
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0
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10
22
1.62
108985973--108986145
58
3.0
59
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5
163
43
15
15
25
1.86
108995592--108995621
15
1.9
16
93
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53
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10
3
20
1.35
109000318--109000364
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17
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29
0
2
68
1.02
109000318--109000359
8
5.0
8
91
8
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26
0
2
71
0.98
109000318--109000359
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26
0
2
71
0.98
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12
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0
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25
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1.84
109002495--109002533
3
13.0
3
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33
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28
1.71
109003195--109003243
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2.3
21
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0
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34
12
16
36
1.86
109011009--109011083
18
4.2
18
94
0
132
34
17
21
26
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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14
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0
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0
0
29
0.88
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10
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10
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0
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17
2
17
1.46
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2.0
21
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0
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24
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9
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81
2.0
81
82
2
196
37
17
25
20
1.94
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2.8
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0
316
30
21
16
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1.95
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2.0
21
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0
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19
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21
29
1.98
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2.0
24
100
0
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24
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1.95
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1.82
109042389--109042486
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1.82
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1.9
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1.29
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2.0
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2
205
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1.93
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0
316
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16
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1.95
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2.0
24
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1.65
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24
2.2
24
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3
9
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1.54
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21
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0
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21
29
1.98
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2.7
60
94
0
283
30
21
16
31
1.96
109072620--109072662
11
4.0
11
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61
20
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4
27
1.71
109072620--109072661
21
2.0
22
90
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68
21
47
2
28
1.63
109073194--109073304
18
6.2
18
93
0
195
29
23
16
30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109077351--109077403
11
4.9
11
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4
81
20
47
1
30
1.61
109087025--109087160
19
7.2
19
92
5
213
39
9
14
36
1.79
109087025--109087160
55
2.4
56
88
7
202
39
9
14
36
1.79
109087601--109087834
113
2.1
113
82
8
282
21
22
24
31
1.98
109088166--109088214
18
2.5
21
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9
59
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10
2
26
1.39
109088480--109088510
15
2.0
16
93
6
55
16
0
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1.47
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0
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0
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1.31
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2.1
231
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0
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19
33
1.95
109089296--109089840
230
2.4
229
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2
644
28
18
19
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1.95
109090134--109090177
19
2.3
19
84
0
61
31
43
2
22
1.66

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344