Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  220  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Period
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Copy
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Indels
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23
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
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(0-2)
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233
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15
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1.96
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15
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147
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14
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40
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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5.2
19
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15
10
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0.59
73268341--73268365
11
2.3
11
100
0
50
84
0
0
16
0.63
73271405--73271438
3
11.3
3
100
0
68
35
0
0
64
0.94
73275329--73275359
16
1.9
16
93
0
53
54
16
12
16
1.71
73278307--73278332
10
2.6
10
100
0
52
53
19
15
11
1.71
73280020--73280151
47
2.8
48
81
5
142
25
20
29
25
1.99
73289465--73289502
17
2.3
17
86
4
51
68
2
0
28
1.03
73289646--73289683
18
2.2
18
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9
53
68
2
7
21
1.28
73298082--73298125
19
2.2
21
84
8
56
47
6
2
43
1.42
73298965--73299024
16
3.8
16
71
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50
18
0
28
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1.45
73299001--73299053
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23
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0
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22
0
30
47
1.52
73299144--73299233
19
4.8
19
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10
105
34
0
22
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1.53
73299144--73299233
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38
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34
0
22
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1.53
73299760--73300141
126
3.0
126
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0
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17
17
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7
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100
0
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28
1.32
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48
2.8
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6
146
52
6
8
31
1.58
73313718--73313767
3
16.7
3
87
0
73
62
2
2
34
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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36
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0
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19
36
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78
2.0
79
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1
246
39
8
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46
1.59
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5
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5
73
18
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37
3
0
58
1.15
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96
2.0
96
97
0
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1.91
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44
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0
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27
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29
2.0
29
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0
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1.92
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73
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0
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1.94
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116
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1.95
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14
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1.94
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2.6
29
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5
0
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13
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0
0
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2.2
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21
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34
1.84
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19
4.2
19
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9
126
35
16
10
37
1.82
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36
2.0
38
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35
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1.82
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15
10
38
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84
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1.99
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19
162
27
21
21
29
1.99
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7
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1
15
0
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9
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1
15
0
82
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22
2.5
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13
89
1
14
0
83
0.72
73358047--73358121
22
3.3
23
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12
75
1
16
0
82
0.73
73363702--73363767
19
3.2
21
87
6
64
36
19
9
34
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73363719--73363797
19
4.2
19
90
9
126
35
16
10
37
1.82
73363741--73363797
17
3.5
15
88
11
53
35
15
10
38
1.82
73363719--73363797
36
2.1
39
90
9
128
35
16
10
37
1.82
73369295--73369460
85
1.9
85
83
1
215
33
25
18
23
1.97
73369296--73369522
42
5.3
42
80
2
193
35
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22
1.96
73369665--73369715
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2.7
19
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25
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1.68
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25
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160
33
0
19
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1.55
73382095--73382216
9
13.6
9
78
6
131
32
0
20
45
1.57

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344