Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  111961792

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   

This is table  82  of  344  ( 41197 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27184757--27184908
24
6.4
23
89
4
214
29
22
22
25
1.99
27184757--27184908
47
3.2
47
88
3
216
29
22
22
25
1.99
27184757--27184908
71
2.1
71
93
1
259
29
22
22
25
1.99
27185117--27185179
31
2.0
31
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0
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1.93
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2.9
37
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19
24
1.98
27187972--27188115
50
2.9
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182
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1.83
27188126--27188197
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3.1
22
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1.93
27188030--27188226
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4.1
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28
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1.88
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40
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37
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0
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1.97
27193951--27194143
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193
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25
3.2
25
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29
27
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22
3.1
22
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24
58
25
29
12
33
1.92
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47
4.1
47
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3
207
28
27
8
35
1.86
27194011--27194207
94
2.1
96
81
4
229
28
27
8
35
1.86
27196769--27196950
98
1.9
98
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0
301
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1.67
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2.8
44
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37
12
22
26
1.90
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47
2.6
47
92
0
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36
13
23
27
1.92
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3.6
54
83
4
239
36
18
23
21
1.95
27200273--27200471
108
1.8
109
89
1
310
35
18
24
22
1.95
27204459--27204573
29
4.0
28
76
12
101
31
29
14
24
1.95
27204474--27204573
29
3.5
29
81
6
105
33
27
14
26
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27205938--27205987
16
3.1
16
88
0
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14
4
30
52
1.59
27205946--27205987
8
5.2
8
88
0
66
11
2
30
54
1.49
27205938--27205987
24
2.1
24
84
0
64
14
4
30
52
1.59
27211258--27211334
29
2.7
29
89
0
109
28
28
15
27
1.96
27212695--27212738
16
2.8
16
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0
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20
9
25
45
1.80
27218005--27218097
29
3.3
29
85
8
129
29
27
15
27
1.96
27217975--27218089
57
2.0
56
80
8
126
26
33
14
24
1.94
27218308--27218358
8
6.4
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80
8
59
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23
19
50
1.69
27219293--27219327
14
2.8
12
84
16
52
31
20
17
31
1.95
27219298--27219324
14
1.9
14
100
0
54
33
22
14
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1.94
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3.8
8
95
0
51
16
0
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15
2.1
15
93
0
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54
25
0
19
1.44
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2.7
27
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33
9
28
29
1.88
27233128--27233206
40
2.0
40
87
5
115
15
16
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1.90
27235532--27235663
58
2.3
58
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135
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18
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28
1.97
27236038--27236139
48
2.1
48
92
0
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44
11
15
28
1.82
27242100--27242154
23
2.4
23
79
8
60
3
41
0
54
1.18
27243811--27243841
14
2.2
14
94
0
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16
3
3
77
1.03
27246022--27246060
21
1.9
20
84
5
51
53
7
30
7
1.57
27251435--27251657
40
5.6
40
85
3
236
26
27
21
24
1.99
27251589--27251666
40
1.9
41
82
10
97
26
28
21
23
1.99
27257218--27257393
46
3.8
46
76
14
191
23
20
27
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27257215--27257385
93
1.8
93
92
2
290
23
21
27
28
1.99
27280420--27280453
16
2.1
16
100
0
68
23
17
11
47
1.81
27281451--27281493
21
2.0
21
81
0
50
4
18
4
72
1.20
27282006--27282076
29
2.4
29
92
0
124
21
25
32
21
1.98
27283425--27283478
21
2.8
20
86
8
67
51
0
5
42
1.25
27283975--27284024
26
1.9
26
95
0
91
12
2
26
60
1.43
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16
4.8
16
70
19
61
61
12
3
22
1.48
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10
3.4
10
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0
50
70
0
0
29
0.87
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20
3.2
20
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12
64
67
0
1
30
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1.9
19
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29
13
10
45
1.77
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3.6
46
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10
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21
26
28
1.99
27311912--27312082
93
1.8
93
88
0
261
23
21
27
27
1.99
27328021--27328189
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46
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12
175
23
19
26
31
1.98
27328014--27328184
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1.8
93
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2
263
22
20
26
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1.98
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0
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30
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1.9
174
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1.94
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190
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29
17
23
1.97
27380456--27380642
101
1.9
99
84
6
252
27
29
17
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27381821--27381884
19
3.4
19
80
4
76
76
3
0
20
0.92
27381831--27381887
20
2.9
20
84
2
71
73
3
0
22
0.98
27382461--27382528
3
22.3
3
73
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30
0
7
61
1.23
27382468--27382539
23
3.1
23
82
11
67
31
1
11
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1.43
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3
93
0
59
32
0
0
67
0.91
27382878--27383009
64
2.1
64
84
11
173
37
5
2
55
1.35
27382940--27382999
20
3.0
18
76
21
57
35
5
1
58
1.30
27383358--27383452
38
2.5
37
78
13
97
36
12
1
49
1.48
27389420--27389603
40
4.6
40
84
2
253
25
26
23
25
2.00
27389384--27389603
80
2.8
79
86
4
275
25
26
23
24
2.00
27392016--27392120
35
3.0
35
95
0
192
19
25
18
37
1.94
27394232--27394382
27
5.6
27
84
3
160
27
29
15
27
1.96
27394232--27394381
55
2.8
54
83
4
167
28
29
15
27
1.96
27402318--27402495
27
6.6
27
83
5
189
28
28
15
26
1.96
27402339--27402494
82
1.9
81
85
6
217
28
28
16
26
1.97
27406807--27406915
58
1.9
57
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9
132
24
32
14
28
1.95
27409942--27410066
43
3.0
43
82
5
148
28
19
22
30
1.98
27409920--27410074
42
3.7
43
78
10
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27
20
23
29
1.99
27412562--27412703
40
3.6
40
91
2
225
25
26
23
24
2.00
27416200--27416341
40
3.6
40
86
0
187
23
21
26
28
1.99
27422953--27423110
42
3.7
42
74
12
162
24
17
25
32
1.97
27426649--27426804
42
3.7
42
77
6
154
26
18
24
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27437393--27437550
43
3.7
42
84
7
203
24
18
26
30
1.98
27437952--27438002
26
2.0
26
100
0
102
31
0
21
47
1.51
27440159--27440267
21
5.2
21
92
0
182
45
17
22
14
1.84
27444536--27444561
7
3.7
7
100
0
52
23
15
0
61
1.33
27449112--27449160
18
2.5
19
87
9
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34
0
2
63
1.06
27449120--27449160
21
2.0
20
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4
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36
0
0
63
0.95
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28
2.0
28
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0
103
14
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21
30
1.93
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40
5.1
40
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1
313
25
28
23
22
1.99
27468931--27469134
40
5.1
40
92
1
304
25
28
23
22
1.99
27473410--27473455
20
2.4
19
85
7
58
23
2
23
50
1.61
27476933--27476966
17
2.0
17
100
0
68
29
5
23
41
1.78
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20
2.2
19
86
8
57
70
0
2
26
0.99
27477838--27477867
15
2.0
15
100
0
60
33
13
20
33
1.91
27479822--27479896
35
2.1
35
97
0
141
22
16
24
37
1.93
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55
6.5
55
78
4
329
30
15
24
29
1.96
27481166--27481513
110
3.2
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398
30
16
24
29
1.96
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165
1.9
165
84
2
414
30
15
24
29
1.95
27481398--27481513
28
4.3
27
76
8
92
26
17
26
29
1.97
27482605--27482638
14
2.3
15
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5
52
26
2
20
50
1.63
27482835--27482893
31
1.9
31
86
6
84
20
22
22
35
1.96
27489949--27489987
21
2.0
20
85
10
53
17
12
23
46
1.83
27489968--27490583
69
9.1
69
75
6
405
19
22
19
38
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27489979--27490439
207
2.2
207
79
2
487
18
23
19
38
1.93
27500300--27500356
25
2.3
25
81
0
69
21
28
26
24
1.99
27502751--27502804
26
2.1
26
100
0
108
42
16
0
40
1.48
27505180--27505285
43
2.5
42
84
4
142
20
17
29
32
1.96
27505300--27505398
51
2.0
50
83
2
126
25
17
26
31
1.97
27508034--27508295
40
6.6
40
85
3
298
24
19
27
27
1.99
27508034--27508295
79
3.3
78
87
3
328
24
19
27
27
1.99
27508035--27508295
119
2.2
121
82
4
316
24
19
27
27
1.99
27508034--27508330
79
3.8
78
82
6
305
25
19
27
26
1.99
27515956--27516178
40
5.6
40
85
3
245
24
20
28
26
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
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          337   338   339   340   341   342   343   344